在侵犯商标权案件结案后，对于实体证物的处理，通常遵循以下原则和方式：

1. 根据法院判决或调解结果处理：

   • 若法院判决明确要求销毁侵权商品，则当事人需按照判决要求，在监督下进行销毁，确保侵权商品不再流入市场。
   • 若判决或调解结果允许对侵权商品进行其他处理方式（如捐赠给慈善机构，但需确保不会对商标权造成进一步侵害），则当事人需按照指定方式处理。

2. 考虑证物的保存与归档需求：

   • 对于具有特殊价值或可能作为后续案件证据的证物，法院或相关机构可能会决定保留一段时间，并进行妥善保存和归档。
   • 在此情况下，当事人需配合法院或相关机构的工作，确保证物的完整性和安全性。

3. 当事人协商处理：

   • 在某些情况下，若双方当事人对证物的处理达成一致意见，且该处理方式不违反法律法规和公序良俗，法院可能会尊重当事人的意愿，允许其按照协商结果处理证物。
   • 例如，双方可能同意将侵权商品用于教学、研究等非商业用途，但需确保不会对商标权造成损害。

4. 依法进行拍卖或变卖（如适用）：

   • 对于某些具有市场价值的侵权商品，若法院认为拍卖或变卖是更合适的处理方式，且符合相关法律法规的规定，可能会组织拍卖或变卖程序。
   • 在此情况下，拍卖或变卖所得通常需上缴国库或按照法院判决进行分配。

在处理过程中，当事人需特别注意以下几点：

• 确保处理方式符合法律法规和公序良俗，避免对商标权造成进一步侵害。
• 配合法院或相关机构的工作，提供必要的协助和支持。
• 保留好相关证据和文件，以备后续需要。

如有任何关于侵犯商标权案件结案后实体证物处理的具体问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。