关于“专利代协议是否合法”的问题，首先我们需要明确的是，专利代协议的合法性主要取决于代签行为是否得到了合法的授权。
合法授权下的代签：
- 如果代签者持有被代签人的合法授权委托书，并且明确授意他代签专利协议，那么该代签行为是有效的，即代签的专利协议是合法的。
- 在这种情况下，代签者所签署的协议将被视为被代签人的真实意思表示，具有法律效力。
无合法授权或超越授权范围的代签：
- 如果代签者没有书面授权档，或者其授权权限内并不涵盖专利协议的签署，那么代签者的行为将被视为非法，即代签的专利协议是不合法的。
- 此外，即使代签者声称自己有权代表被代签人，但如果相对方（即与代签者签订协议的一方）没有充分理由相信代签者拥有代理权，或者代签者在客观上未展现出代理权的表征，那么代签行为也可能被视为无效。
特殊情况下的代签：
- 在某些特殊情况下，如被代签人因故无法亲自签署协议，且情况紧急，需要他人代为处理时，可能会存在口头授权或默示授权的情况。但这种情况下，代签者需要能够提供充分的证据证明其代签行为得到了被代签人的授权，否则仍可能被视为非法代签。
综上所述，专利代协议的合法性主要取决于代签行为是否得到了合法的授权。因此，在进行专利代签时，务必确保代签者持有合法的授权委托书，并且明确授意他代签专利协议。如果无法确定代签者的授权情况，建议谨慎处理，以免引发不必要的法律纠纷。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。