是的，商标侵权行政机关可以给予警告。

在商标侵权案件中，行政机关作为执法部门，有权对侵权行为进行查处。根据相关法律法规，对于商标侵权行为，行政机关可以采取多种处罚措施，其中就包括给予警告。警告作为一种轻微的处罚措施，旨在提醒和告诫侵权人停止其侵权行为，并防止类似行为再次发生。

具体来说，当行政机关发现商标侵权行为时，他们会进行调查取证，并根据侵权行为的性质和情节，决定是否给予警告。如果侵权行为较轻，且侵权人能够及时停止侵权行为并采取措施消除影响，行政机关可能会选择给予警告作为处罚。而如果侵权行为较为严重，或者侵权人拒不停止侵权行为，行政机关则可能会采取更严厉的处罚措施，如罚款、没收违法所得等。

因此，对于商标侵权行为人来说，收到行政机关的警告后，应当引起足够的重视，及时停止侵权行为，并采取措施消除影响，以避免进一步的法律后果。如果你有任何关于商标侵权的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。