在套牌人与被套牌人系亲属关系，且被套牌车辆发生事故的情况下，举证责任的分配主要依据事故责任认定、车辆使用情况以及亲属关系等因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、事故责任认定的基本原则
在交通事故中，事故责任的认定通常依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例进行。一般来说，事故责任由造成事故的一方承担。在套牌车事故中，若套牌车驾驶员被认定为事故责任方，则其应承担相应的赔偿责任。然而，当套牌人与被套牌人系亲属关系时，情况可能更为复杂，因为这可能涉及到车辆的实际使用、管理以及亲属间的责任分担等问题。
二、举证责任的具体分配
主张套牌车驾驶员承担责任的一方：
- 需提供证据证明套牌车驾驶员是事故的实际造成者，如交通事故认定书、现场监控录像、证人证言等。
- 若主张被套牌人（车主）也需承担责任，则需进一步提供证据证明车主对套牌行为知情或存在过错，如车主与套牌车驾驶员之间的通讯记录、车主对车辆管理的疏忽等。
被套牌人（车主）的反驳举证责任：
- 若被套牌人否认对套牌行为知情或存在过错，则应承担反驳的举证责任。
- 被套牌人可以提供证据证明自己对车辆的管理是严格的，如车辆停放记录、钥匙保管情况等，以证明自己对套牌行为并不知情。
- 若被套牌人能证明套牌车驾驶员是未经允许擅自使用车辆，且自己对此并不知情，则可能减轻或免除其赔偿责任。
特殊情形的举证责任：
- 在亲属关系复杂或存在其他特殊情况时，举证责任可能更加繁重。例如，若套牌车驾驶员与被套牌人之间存在经济往来或共同利益关系，则可能被视为共同侵权人，需共同承担赔偿责任。
- 在此情况下，双方均需提供充分证据证明自己的主张或反驳对方的主张，以维护自己的合法权益。
三、举证不能的后果
- 若主张套牌车驾驶员或被套牌人承担责任的一方无法提供充分证据支持其主张，则可能面临败诉的风险。
- 同样，若被套牌人无法提供有效证据反驳对方的主张，也可能导致对方的主张被法院采纳，从而承担不必要的赔偿责任。
四、法律建议
- 保留证据：在事故发生后，双方均应积极保留与事故相关的所有证据，如交通事故认定书、现场照片、监控录像、证人证言等。
- 及时报警：在事故发生后，应立即报警并等待交警到场处理。交警的调查和认定将作为后续诉讼的重要依据。
- 咨询专业律师：在涉及复杂亲属关系和套牌车事故的情况下，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师将根据具体情况分析举证责任的分配，并帮助制定合适的诉讼策略。
法律依据：
- 《中华人民共和国道路交通安全法》第七十三条：公安机关交通管理部门应当根据交通事故现场勘验、检查、调查情况和有关的检验、鉴定结论，及时制作交通事故认定书，作为处理交通事故的证据。交通事故认定书应当载明交通事故的基本事实、成因和当事人的责任，并送达当事人。
综上所述，在套牌人与被套牌人系亲属关系且被套牌车辆发生事故的情况下，举证责任的分配需综合考虑事故责任认定、车辆使用情况以及亲属关系等因素。双方均应积极保留证据并咨询专业律师以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。