结论前置：无证跑网约车16天后停止运营，仍可能面临罚款，具体分析如下：

1. 行政处罚的时效性
   根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，期限延长至五年）。因此，即使您已停止运营16天，只要在追溯期内被交通执法部门查实，仍可能被处罚。

2. 无证运营的处罚依据
   根据《网络预约出租汽车经营服务管理暂行办法》第三十四条，未取得《网络预约出租汽车运输证》或《网络预约出租汽车驾驶员证》擅自从事网约车经营的，由县级以上出租汽车行政主管部门责令改正，予以警告，并处以1万元以上3万元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   关键点：处罚针对的是“无证经营行为”，而非“持续时长”。即使仅运营16天，只要被查实存在无证经营事实，即可能面临处罚。

3. 停止运营后的风险

• 已查实的违法行为：若在运营期间被执法部门通过乘客投诉、平台数据、路面检查等方式留存证据（如订单记录、支付凭证等），即使停止运营，仍可能被追溯处罚。
  
• 未查实的违法行为：若未留下证据且未被举报，可能暂时未被发现，但若后续被举报或平台数据被调取，仍可能面临处罚。

1. 建议处理方式
   

• 主动配合调查：若已收到交通执法部门的通知或处罚决定，建议积极配合调查，如实说明情况，争取从轻处理（如首次违法且情节轻微，可能被减轻或免除罚款）。
  
• 补办证件：若计划继续从事网约车行业，需尽快办理《网络预约出租汽车运输证》和《网络预约出租汽车驾驶员证》，避免再次违法。
  
• 法律咨询：若对处罚决定有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。

总结：无证跑网约车16天后停止运营，仍可能因之前的违法行为被处罚。建议您关注是否收到执法部门的通知，并主动处理相关事宜。如有进一步疑问，可直接向我咨询。