关于在职竞业限制赔偿金的计算，这确实是一个涉及法律条款和实际操作细节的问题。首先，我们需要明确的是，竞业限制赔偿金的计算并非一成不变，而是受到多种因素的影响，包括法律规定、双方协议约定、劳动者的收入水平、用人单位的损失情况以及劳动者的过错程度等。

一、法律依据与常规做法

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在竞业限制协议中约定违约金或赔偿方式。在缺乏明确约定的情况下，司法实践中通常会参考劳动者离职前十二个月平均工资的一定比例（如30%）作为竞业限制补偿金的基准，同时这个基准不得低于当地最低工资标准。以月薪6000元为例，按照这一常规做法，每月至少应支付的竞业限制补偿金为6000元×30%=1800元。

二、赔偿方式及标准

1. 按照约定支付违约金：

   • 如果竞业限制协议中明确约定了违约金的数额或计算方式，那么劳动者违反竞业限制义务时，就需要按照约定向用人单位支付违约金。这个违约金数额可能是一个固定值，也可能是根据劳动者离职前工资、用人单位损失等因素动态计算的。

2. 赔偿实际损失：

   • 如果协议中没有约定违约金，或者约定的违约金不足以弥补用人单位的实际损失，那么劳动者需要赔偿用人单位因其违约行为所遭受的实际损失。这包括用人单位因劳动者违约而失去的商业机会、客户流失、市场份额下降等所导致的经济损失。

3. 继续履行竞业限制义务：

   • 在某些情况下，用人单位可能更希望劳动者继续履行竞业限制义务，而不是仅仅要求其支付违约金或赔偿损失。这通常发生在劳动者违约行为尚未造成严重后果，或者用人单位认为继续履行竞业限制义务对其更有利的情况下。

三、赔偿金额的确定因素

在确定赔偿金额时，法院或仲裁机构会综合考虑以下因素：

• 劳动者的收入水平：收入越高的劳动者，其违约行为可能对用人单位造成的损失也越大。
• 竞业限制协议的约定：协议中的约定是确定赔偿金额的重要依据。
• 用人单位的损失情况：用人单位需要提供证据证明其因劳动者违约所遭受的实际损失。
• 劳动者的过错程度：故意违反竞业限制协议的劳动者，其过错程度较高，赔偿金额可能会相应增加。

四、实际操作建议

1. 明确协议约定：在签订竞业限制协议时，双方应明确约定违约金的数额或计算方式，以及赔偿实际损失的具体标准。
2. 保留证据：用人单位在追究劳动者违约责任时，需要提供充分的证据证明劳动者违反了竞业限制协议以及其所遭受的损失。
3. 及时采取法律措施：一旦发现劳动者违反竞业限制协议，用人单位应及时采取法律措施维护自身权益，避免损失扩大。

五、针对月薪6000元的特殊情况

对于月薪6000元的劳动者来说，其竞业限制补偿金的基本计算方式为6000元×30%=1800元。但实际支付的补偿金数额可能因双方约定、地区和行业差异而有所上浮。如果双方在协议中约定了更高的补偿金数额，或者所在地区、行业有更高的补偿标准，那么实际支付的补偿金可能会超过1800元。但无论如何，这个数额都不会超过劳动者原月薪的总额（即6000元），除非双方有特别约定且该约定不违反法律法规的强制性规定。

综上所述，在职竞业限制赔偿金的计算是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。如果您或您的用人单位面临这样的问题，建议咨询专业的法律人士以获取更具体、更准确的解答。