关于您提出的“卫健委查户口本是否合法”的问题，首先需要明确的是，卫健委（国家卫生健康委员会）本身并不直接负责户口本的查询或管理工作。户口本的管理和查询主要由公安机关负责，这是依据《中华人民共和国户口登记条例》等相关法律法规来执行的。

卫健委的主要职责是围绕公共卫生、医疗服务、计划生育等方面进行管理和监督，比如您之前提到的出生医学证明的管理。出生医学证明是依据《中华人民共和国母婴保健法》制发的，它是公安机关进行新生儿户口登记的重要依据，但这并不意味着卫健委有权直接查询或管理户口本。

如果卫健委在特定情况下（如打击伪造出生医学证明等违法犯罪行为时）需要与公安机关合作，可能会涉及到一些与户口本相关的信息交换或协助调查，但这都是在法律框架内，且经过严格程序进行的，并非卫健委单方面可以随意查询户口本。

因此，从一般意义上来说，卫健委并不直接查户口本，也不具备这样的法定权力。如果您对户口本的管理或查询有疑问，建议直接咨询当地的公安机关或相关部门，以获取更准确、更权威的信息。

希望这个解答能够清晰、详细地解答您的疑问。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。