若申请人发现区检察院对民事案件作出的书面文件存在错误，可按以下步骤处理：

1. 确认错误类型与性质
   首先需明确书面文件中的错误属于何种类型，例如：
   

• 事实认定错误：如案件事实描述与实际情况不符；
  
• 法律适用错误：如引用法律条文错误或解释偏差；
  
• 程序性错误：如未依法履行告知、送达等程序；
  
• 文字表述错误：如笔误、数据错误等不影响实质权利的形式瑕疵。
  

1. 根据错误类型选择救济途径

   • 若为事实认定或法律适用错误：
     可向区检察院的上一级检察院（市检察院）提出民事检察监督申请，要求其通过抗诉或检察建议的方式纠正错误。根据《人民检察院民事诉讼监督规则》第二十一条，当事人认为民事生效裁判、调解书存在法定监督情形的，可向同级或上级检察院申请监督。
     操作建议：提交书面申请时需附原法律文书、新证据（如有）及详细说明错误理由，建议同步附上相关法律依据（如《民事诉讼法》第二百零七条关于再审情形的规定）。

   • 若为程序性错误：
     可向区检察院内部监督部门（如案件管理办公室）提出书面异议，要求其启动内部纠错程序。例如，若检察院未依法送达文书导致当事人丧失上诉权，可依据《人民检察院刑事诉讼规则》第五百五十七条（民事程序参照适用）要求补正。

   • 若为文字表述错误：
     可直接联系案件承办检察官或书记员，要求出具补正裁定书或书面更正说明。此类错误通常不影响实体权利，但需留存更正证据以备后续争议。

2. 特殊情形处理

   • 若错误已导致实际损失：
     可同步向法院提起国家赔偿申请（如因检察院错误执行导致财产损失），或通过民事诉讼主张权利（如检察院错误介入导致合同违约）。
     
   • 若检察院拒绝纠正：
     可向同级人大常委会或上级检察院反映情况，或通过信访渠道寻求监督，但需注意保留书面沟通记录作为证据。
     

温馨提示：法律程序具有时效性，例如民事检察监督申请需在知道或应当知道错误之日起六个月内提出（参考《人民检察院民事诉讼监督规则》第二十条）。建议尽快行动并保留所有书面材料原件。

如有进一步疑问或需协助起草法律文书，可直接向我提问，我将结合具体案情提供详细方案。