您好，关于合法改装车辆后需要做的变更手续，这是一个涉及多个方面且需要细致操作的问题。以下是我为您整理的详细解答：
首先，我们要明确哪些改装是合法的。根据公安行业标准《机动车查验工作规程》(GA801-2019)以及相关法律法规，车主在保证安全、不影响识别号牌和不改变车身长度、宽度的情况下，可以对小微型客车进行一些合法改装，如加装车顶行李架、脚踏板，改装进气格栅、保险杠，更换轮毂和车身颜色等。但这些改装都有具体的限制条件，比如行李架的高度不能超过30厘米，脚踏板不能构成车外凸出物，换装轮毂不得改变已登记的轮胎规格等。
接下来，我们重点说说改装后需要做的变更手续：
车身颜色变更：
- 如果您改变了车身颜色，必须在变更后的十日内将车辆开到车管部门进行备案。
- 备案时，您需要提交机动车所有人的身份证明、机动车登记证书、机动车行驶证，并交验机动车。
- 车管部门会重新录入变更后的车身颜色，重新拍照，并办理变更登记手续。
其他改装备案：
- 对于加装车顶行李架、脚踏板，改装进气格栅、保险杠，更换轮毂等改装，虽然这些改装在合法范围内，但如果您进行了这些改装，并且改装后的车辆状态与行驶证上的照片或登记信息不符，也建议您在改装后到车管部门进行备案或咨询是否需要备案。
- 备案流程通常与车身颜色变更类似，需要提交相关证明和凭证，并交验机动车。
注意事项：
- 非法改装车辆是违法行为，不仅可能面临罚款，还存在较大的安全隐患。因此，请务必遵守交通法规，不要进行非法改装。
- 如果您不确定某个改装是否合法或是否需要备案，建议先咨询当地车管部门或专业机构，以免因不了解规定而违法。
- 改装后的车辆在通过查验或年检时，必须确保所有改装都符合标准且已完成备案和变更登记手续。否则，车辆可能无法通过查验或年检，甚至可能被扣留。
最后，我想提醒您的是，爱车要适度，改装须理性。在追求个性和时尚的同时，也要确保车辆的安全性和合法性。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地车管部门或专业机构。