检察院驳回的案子一般不会留下案底。案底通常指的是犯罪记录，它是在人民法院判处犯罪嫌疑人有罪后形成的。而检察院驳回案子，意味着案件在审查起诉阶段就被终止，没有进入审判阶段，因此不会产生犯罪记录。

详细分析如下：

1. 刑事公诉案件中的撤诉情况：

   • 若检察院在侦查阶段决定撤案，或在审查起诉阶段作出不起诉决定（这相当于撤诉），犯罪嫌疑人是不会有案底的。因为在这两个阶段，案件尚未进入审判阶段，未经人民法院依法判决，不得确定任何人有罪。
   • 在审判阶段，如果检察院因证据不足或其他正当理由撤诉，只要后续没有新的证据导致案件被重新起诉并被法院判定有罪，那么犯罪嫌疑人同样不会留下案底。

2. 刑事自诉案件中的撤诉情况：

   • 刑事自诉案件中，自诉人（原告）有权撤诉。这类案件本质上是公民个人之间的纠纷，与检察院无关。因此，自诉案件撤诉后，被告人是不会留下案底的。

3. 民事案件和行政案件中的撤诉情况：

   • 民事案件和行政案件与刑事案件不同，它们不涉及“检察院撤诉”的情况。这两类案件由原告进行撤诉操作，且撤诉结果与刑事案底无关。因此，民事案件或行政案件的撤诉不会留下刑事意义上的案底。

4. 检察院撤诉的具体原因：

   • 检察院撤诉可能基于多种原因，如不存在犯罪事实、犯罪事实并非被告人所为、情节显著轻微危害不大等。在这些情况下，由于案件未进入审判阶段或未被法院判定有罪，因此不会留下案底。

注意事项：

• 虽然检察院撤诉后不会留下案底，但当事人仍需关注案件的后续发展。如果后续发现新证据或符合起诉条件，检察院是有可能再次提起诉讼的。
• 撤诉也可能对当事人的声誉等方面产生一定影响。因此，当事人在面对检察院撤诉时，应谨慎处理相关事宜，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议。

综上所述，检察院驳回的案子一般不会留下案底。但当事人仍需关注案件的后续发展及可能产生的法律后果，并咨询专业律师以获取更全面的法律帮助。如果你有任何法律问题或需要进一步的咨询，请直接向我提问。