企业调查期间一般不可以注销，但具体需根据调查类型和阶段来判断，以下是详细分析：

1. 税务调查期间
   若企业正处于税务稽查、税务评估等税务调查阶段，根据《税收征收管理法》第十六条及其实施细则相关规定，企业需在完成税务清算、缴清税款及滞纳金、接受税务处罚（如有）后，方可办理注销登记。若在调查期间擅自注销，税务机关可追缴税款、加收滞纳金，并可能对企业及直接责任人员处以罚款。

2. 市场监管调查期间
   若企业因涉嫌虚假登记、不正当竞争、垄断等行为被市场监管部门立案调查，根据《市场主体登记管理条例》第三十一条规定，企业需在调查终结或处罚执行完毕后，方可申请注销。若在调查期间注销，市场监管部门可撤销注销登记，恢复企业主体资格，并依法追究法律责任。

3. 刑事调查期间
   若企业或其直接责任人员涉嫌犯罪被公安机关立案侦查，根据《刑事诉讼法》相关规定，企业作为单位犯罪主体，需在刑事诉讼程序终结（如判决生效）后，方可处理注销事宜。若在侦查、审查起诉或审判阶段注销，可能构成“毁灭证据、干扰诉讼”行为，相关责任人员可能被追究刑事责任。

4. 特殊情形：调查前已启动注销程序
   若企业在调查启动前已依法提交注销申请，但尚未完成注销登记，需根据调查类型暂停或终止注销程序：

   • 税务调查：需向税务机关补充申报税款、接受处理后，方可继续注销；
     
   • 市场监管调查：需等待调查结论，若涉及行政处罚，需履行处罚义务后再注销；
     
   • 刑事调查：需立即中止注销，配合司法机关调查。

建议：若企业面临调查且拟注销，应先评估调查类型、阶段及法律风险，必要时通过法律程序申请中止调查或协调处理。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我将结合实务经验提供针对性方案。