结论前置：机动车被查封后被水泡，保险公司赔偿金的归属需根据查封性质、保险合同约定及实际损失情况综合判断，具体分以下两种情况说明：

1. 若查封为行政强制措施（如交警扣车、法院保全）
   根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第22条及《保险法》第48条，行政查封期间车辆所有权仍属车主，但车辆使用、管理权受限。此时需分情况讨论：

   • 若保险合同未明确约定查封期间免责：保险公司需按合同约定赔偿，赔偿金直接支付给车主（或车主指定的合法继承人/受让人）。但需注意，若查封机关已对车辆损失提出权利主张（如因车主违法导致查封，查封机关可能要求赔偿金优先用于弥补公共利益损失），则需通过协商或诉讼确定最终归属。
     
   • 若保险合同明确约定查封期间免责：保险公司可拒赔，车主需自行承担损失。但若车主能证明查封与水泡无因果关系（如查封期间车辆停放于合法场所，因暴雨等不可抗力导致水泡），可主张免责条款无效，要求保险公司赔偿。

2. 若查封为司法拍卖前的扣押（如法院执行阶段）
   根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第26条，查封期间车辆由法院保管，但所有权仍属被执行人（车主）。此时：

   • 若保险合同未约定查封期间免责：保险公司赔偿金原则上归车主所有，但法院可依据《民事诉讼法》第243条，要求车主将赔偿金用于清偿债务。若车主未履行债务，法院可直接划扣赔偿金。
     
   • 若车辆已进入拍卖程序：根据《最高人民法院关于人民法院网络司法拍卖若干问题的规定》第12条，水泡损失若影响车辆评估价值，法院可能要求保险公司将赔偿金支付至法院账户，用于重新评估或补偿买受人损失。

补充说明：

• 关键证据：车主需保留保险合同、查封通知书、水泡现场照片/视频、维修报价单等证据，以证明损失与查封的关联性及赔偿金额的合理性。
  
• 争议解决：若对赔偿归属有争议，可通过协商、调解或诉讼解决。诉讼时需以保险公司、查封机关（如涉及）为共同被告/被申请人，明确诉求及法律依据。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您详细分析。