危害国家重点保护植物罪在判定罪免处的情况下，违法所得仍会被追缴。以下从不同角度为你详细分析：

法律依据角度

根据我国《刑法》第六十四条的规定：“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。”这一条款明确了追缴违法所得是刑事诉讼中对犯罪分子违法所得财物的一种处理方式，它并不以犯罪分子是否被判处刑罚为前提。也就是说，只要犯罪分子通过犯罪行为获得了违法所得，无论其最终是否被判处刑罚，包括被判定罪免处（即认定有罪但免予刑事处罚）的情况，都应当对其违法所得进行追缴。

罪免处的性质角度

罪免处，即“定罪免刑”，是指法院认定被告人构成犯罪，但根据案件的具体情况，认为不需要对其判处刑罚，而免予刑事处罚。虽然被告人没有被判处刑罚，但其犯罪行为已经成立，违法所得与犯罪行为之间存在直接的因果关系。追缴违法所得的目的在于剥夺犯罪分子的非法利益，防止其从犯罪行为中获利，维护社会的公平正义和经济秩序。因此，在罪免处的情况下，追缴违法所得仍然是必要的，以实现法律的惩戒和教育功能。

实际案例角度

在实际的司法实践中，也有许多危害国家重点保护植物罪被判定罪免处但追缴违法所得的案例。例如，某被告人非法采伐了国家重点保护植物，在案件审理过程中，被告人认罪态度较好，且犯罪情节相对较轻，法院最终判定其构成危害国家重点保护植物罪，但免予刑事处罚。然而，对于被告人通过非法采伐行为所获得的违法所得，法院仍然依法进行了追缴。

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