结论：交通银行惠民贷逾期协商好后是否会自动扣款，取决于协商的具体内容以及您是否授权了自动扣款功能。

1. 协商内容的影响：

   • 如果在协商过程中，您与交通银行达成了包括自动扣款在内的还款协议，并且您明确同意了自动扣款的相关条款，那么交通银行在约定的还款日是有权从您指定的账户中自动扣款的。
   • 如果协商内容中并未提及自动扣款，或者您明确表示不同意自动扣款，那么交通银行通常不会自动扣款，而是会等待您主动还款。

2. 自动扣款授权的情况：

   • 如果您在申请惠民贷时或之后，已经授权了交通银行从您的某个账户中自动扣款以偿还贷款，那么即使逾期协商后，只要该授权仍然有效，交通银行仍有可能在约定的还款日自动扣款。
   • 如果您想要取消或更改自动扣款的授权，通常需要联系交通银行进行办理。

3. 建议与注意事项：

   • 为了确保还款的顺利进行，建议您在协商逾期还款时，与交通银行明确还款方式、还款日期以及是否自动扣款等关键条款，并保留好相关的协商记录或协议。
   • 如果您担心自动扣款可能带来的问题，如账户余额不足导致的扣款失败或额外费用，您可以考虑选择主动还款的方式，并在还款日前确保账户中有足够的资金。
   • 如果您对交通银行的自动扣款行为有任何疑问或不满，您可以及时联系交通银行进行沟通或投诉，也可以向我咨询相关的法律问题。