针对您提出的“修农耕路被占地了怎么办”的问题，这是一个涉及农民权益保护的重要事项，我将结合相关法律法规和实际操作流程，为您提供一个详细且全面的解答。
一、确认占地行为的合法性
首先，您需要确认修路占地行为是否合法。根据《中华人民共和国土地管理法》的规定，任何建设占用土地，特别是农用地转为建设用地的，都必须依法办理农用地转用审批手续。因此，您有权要求相关部门出示该项目的用地审批文件，核实其是否依法获得了占用耕地修路的许可。如果缺乏合法审批手续，那么该占地行为就是违法的，您有权拒绝并可以向当地自然资源部门进行举报。
二、了解并争取合理的补偿
如果占地行为是合法的，那么接下来您需要了解并争取合理的补偿。根据法律规定，国家征收土地应给予被征地农民公平、合理的补偿，补偿标准应考虑土地类型、质量、地理位置等因素，并确保农民生活水平不降低。补偿费用通常包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费。具体标准如下：
土地补偿费：按被征用土地的原用途补偿，一般为该耕地被征用前三年平均年产值的六至十倍。
安置补助费：根据需要安置的农业人口数计算，每个需要安置的农业人口的安置补助费标准，为该耕地被征用前三年平均年产值的四至六倍，但每公顷被征用耕地的安置补助费最高不得超过被征用前三年平均年产值的十五倍。
地上附着物和青苗的补偿费：具体标准由省、自治区、直辖市规定。
在了解补偿标准后，您应与当地政府相关部门、村委会就补偿问题进行友好协商，提出合理诉求，争取公平合理的补偿方案。协商过程中，建议您保留好相关记录，以备后续维权使用。
三、签订正式的土地补偿协议
当双方就补偿事宜达成一致后，应签订正式的土地补偿协议。协议中应明确双方的权利和义务，包括补偿的具体项目、金额、支付方式以及安置办法等。签订协议后，您应确保补偿款项能够及时足额支付。
四、通过合法途径解决争议
如果在协商过程中无法达成一致，或者您认为补偿不合理、占地行为违法，那么您可以通过以下合法途径来维护自身权益：
申请调解：您可以向当地人民政府或相关调解机构申请调解，以协调双方的利益诉求。
法律途径：如果调解也无法达成一致，您可以向人民法院提起行政诉讼，起诉相关政府部门的违法占地或不合理补偿行为；或者根据具体情况，依据民事诉讼程序，与责任方就补偿纠纷进行诉讼；还可以向当地的仲裁机构申请仲裁，按照仲裁程序解决补偿争议。
五、持续监督与举报
在修路过程中，您应保持关注，确保施工不超出预定范围。如果发现施工单位有违法行为，如超范围施工、破坏耕地等，您应及时向相关部门举报，并保留好相关证据以便维权。
综上所述，当修农耕路被占地时，您应首先确认占地行为的合法性，了解并争取合理的补偿，签订正式的土地补偿协议，并通过合法途径解决争议。同时，您也应持续监督施工过程，确保自身权益不受损害。希望这些建议能对您有所帮助。