乡镇办理违建案件的办件时间确定，除依据《行政处罚法》外，还主要依据以下法律法规及程序规定：
《城乡规划法》的相关规定：
- 根据《城乡规划法》第六十四条，对于未取得建设工程规划许可证或未按照许可证规定进行建设的行为，乡镇政府（或城乡规划主管部门）有权责令停止建设，并可根据违法建设的性质、程度等，要求限期改正或拆除。
- 办件时间的确定：在此过程中，乡镇政府需在发现违建行为后，及时启动调查程序，并在合理期限内作出行政决定。这个“合理期限”虽未具体量化，但应遵循行政效率原则，确保及时、有效地处理违建案件。同时，若要求限期改正或拆除，该期限应在行政决定中明确，并给予违建者合理的履行期限。
地方性法规或规章的补充规定：
- 各地可能根据本地实际情况，制定了关于违建处理的地方性法规或规章，这些法规或规章可能对办件时间有更具体的规定。
- 办件时间的确定：乡镇政府在办理违建案件时，需同时遵守这些地方性法规或规章的规定，确保办件时间的合法性和合理性。例如，某些地方可能规定了从发现违建到作出行政决定的明确时间限制，或规定了限期改正或拆除的具体期限。
行政程序法的原则性要求：
- 除《行政处罚法》外，行政程序法（如《行政许可法》、《行政强制法》等）中的原则性要求，如公开、公正、公平、效率等，也适用于违建案件的办理。
- 办件时间的确定：乡镇政府在办理违建案件时，需遵循这些原则性要求，确保办件过程的透明度和公正性，同时提高行政效率，避免不必要的拖延。例如，在调查取证、听取当事人陈述申辩、作出行政决定等环节，都需在合理期限内完成，并确保当事人的合法权益得到充分保障。
实际操作的灵活性：
- 在实际操作中，乡镇政府可能根据违建案件的复杂程度、违建者的配合程度等因素，对办件时间进行适当调整。
- 办件时间的确定：这种调整应在法律框架内进行，并确保不损害当事人的合法权益。例如，对于复杂案件，乡镇政府可能需要更多时间进行调查取证和听取各方意见；对于违建者积极配合整改的情况，乡镇政府也可以考虑适当缩短办件时间。