关于“配偶知晓同意函是否必须要有双方签字”的问题，这主要取决于具体的应用场景和相关的规定要求。不过，我可以从一般性的角度，结合您提供的参考信息中的类似场景，来给您一个较为全面的解答。

首先，我们需要明确“配偶知晓同意函”的性质和目的。这类函件通常是在涉及夫妻双方共同权益或需要配偶知晓并同意的某些事务时使用的，比如财产处理、贷款申请、租房提取公积金等。其核心目的在于确保配偶对相关事务的知情权，并在必要时表达同意或授权。

针对您的问题，以下是一些一般性的分析：

1. 如果规定或合同中明确要求：在某些特定场景下，比如办理某些金融业务、房产交易或法律手续时，相关机构或部门可能会明确要求“配偶知晓同意函”必须由双方签字确认。这是为了确保双方都对相关事务有充分的了解，并达成一致意见。

2. 如果仅作为知情证明：如果“配偶知晓同意函”主要是作为配偶对某事务的知情证明，而不涉及具体的授权或决策，那么在某些情况下，可能只需要配偶一方签字确认即可。但这种情况相对较少，且具体还需根据相关规定或合同来确定。

3. 结合您提供的参考信息：

   • 在昆明线上办理市场租房提取公积金的场景中，虽然并未直接提及“配偶知晓同意函”的签字要求，但明确指出了配偶需要通过“昆明公积金”完成授权确认。这可以视为一种电子化的“知晓并同意”的方式，虽然不一定需要双方签字，但确保了配偶的知情权和授权。
   • 在其他未直接提及的场景中，如果涉及夫妻共同权益或需要配偶同意的事务，建议还是遵循相关规定或合同的要求，确保“配偶知晓同意函”由双方签字确认，以避免后续可能出现的纠纷或误解。

综上所述：

• 如果相关机构、部门或合同中明确要求“配偶知晓同意函”必须由双方签字确认，那么请务必遵守这一要求。
• 如果未明确要求，但涉及夫妻共同权益或需要配偶同意的事务，建议还是由双方签字确认，以确保双方的知情权和权益得到保障。
• 在某些电子化或线上办理的场景中，可能通过其他方式（如电子签名、授权确认等）来实现配偶的知情和同意，具体还需根据相关规定或平台要求来操作。

希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他具体的问题或场景需要咨询，请随时告诉我。