被侵占基本农田建坟属于违法行为，应当依法制止并恢复土地原状，同时可追究相关责任人的法律责任。以下从多个角度进行分析：

1. 法律定性角度
   根据《土地管理法》第三十七条及《基本农田保护条例》第十七条，基本农田属于严格保护的耕地范畴，禁止任何单位或个人擅自占用建房、建窑、建坟等破坏种植条件的行为。若侵占行为已发生，该行为直接违反上述强制性规定，构成土地违法行为。

2. 处理流程角度

   • 行政查处：发现侵占行为后，应立即向当地自然资源主管部门（原国土资源局）或农业农村部门举报。相关部门将依法立案调查，核实土地性质、侵占面积及用途，并依据《土地管理法》第七十五条责令限期改正（如拆除坟墓、恢复耕种条件），可并处罚款（按占用面积处耕地开垦费2-5倍罚款）。
     
   • 刑事追责：若侵占基本农田面积达到刑事立案标准（如非法占用基本农田5亩以上或基本农田以外的耕地10亩以上），可能构成《刑法》第三百四十二条规定的非法占用农用地罪，需移送公安机关追究刑事责任。
     
   • 民事赔偿：若侵占行为导致土地所有权人（如村集体）或使用权人（如承包农户）遭受损失，可依据《民法典》第一千一百六十五条要求侵权人赔偿恢复费用、收益损失等。

3. 特殊情形处理

   • 历史遗留问题：若坟墓建于《基本农田保护条例》实施前（1999年1月1日前），且符合当地殡葬管理规定，可能属于“合法存在”的特殊情形，需结合地方政策处理。但若后续扩建或翻建，仍需依法审批。
     
   • 公益性迁坟：因公共利益（如工程建设）需迁移坟墓的，应依据《殡葬管理条例》第十条，由建设单位与坟主协商补偿并办理迁坟手续，严禁未经同意强行占用。

4. 实务建议

   • 证据固定：发现侵占行为后，第一时间拍摄现场照片、视频，记录侵占位置、面积及现状，并留存土地权属证明（如承包合同、土地证）。
     
   • 联合举报：若个人举报效果不佳，可联合其他村民或村集体向乡镇政府、县级自然资源部门提交书面举报材料，要求依法履职。
     
   • 法律程序：若行政机关未及时处理，可依据《行政复议法》申请行政复议，或直接向法院提起行政诉讼，要求撤销违法行政行为或履行查处职责。

温馨提示：基本农田保护涉及国家粮食安全战略，任何侵占行为均可能面临严厉处罚。若您遇到此类问题，可直接向我咨询具体处理方案，我将结合您所在地区的政策细节提供针对性建议。