若医疗事故赔偿协议签字后发现金额有误，可按以下步骤处理：

1. 立即与对方协商
   发现金额错误后，应第一时间联系签署协议的另一方（如医院或患者家属），明确指出协议中存在的金额误差，并协商重新签订补充协议或修改原协议。协商时需注意保留书面沟通记录（如邮件、短信、微信等），避免口头约定导致后续争议。
   法律依据：根据《民法典》第543条，当事人协商一致可变更合同内容；第557条，若金额错误属重大误解，可请求法院或仲裁机构撤销协议。

2. 核查错误性质与责任

   • 若为笔误或计算错误：双方可签订补充协议修正金额，并注明原协议因笔误需更正，避免影响其他条款效力。
     
   • 若因一方故意隐瞒或欺诈：例如医院故意少写赔偿金额，受害方可主张协议无效或撤销，并要求按实际损失重新计算赔偿。
     关键点：需证明对方存在过错（如录音、证人证言等），否则可能被认定为“单方疏忽”，需自行承担部分责任。

3. 通过法律途径解决
   若协商无果，可向法院提起诉讼或申请仲裁（视协议约定），要求：

   • 撤销或变更协议：以“重大误解”或“显失公平”为由，请求法院调整赔偿金额；
     
   • 确认协议无效：若金额错误导致协议目的无法实现（如赔偿远低于实际损失），可主张协议整体无效，重新核算赔偿。
     注意：诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。

4. 预防措施建议

   • 签署前仔细核对：要求对方提供赔偿计算明细，并逐项核对金额；
     
   • 留存证据：保存医疗费用单据、鉴定报告等证明实际损失的材料；
     
   • 公证或见证：对大额赔偿协议，可申请公证或邀请第三方见证，增强协议效力。

总结：金额错误需优先协商，协商不成则通过法律途径解决，同时注意保留证据以维护自身权益。若涉及复杂情况（如对方拒不承认错误或赔偿金额争议较大），可直接向我咨询具体操作方案。