针对您提出的“主动上交查不清楚的违法所得怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、背景与法律依据
当您发现自身存在违法行为，并产生了一些难以查清具体来源或金额的违法所得时，主动上交这些所得是配合调查、整改以及避免法律后果的积极行为。根据《中华人民共和国刑法》第六十四条：“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。”同时，根据《行政处罚法》的相关规定，主动消除违法行为危害后果的，可以从轻或减轻处罚。因此，主动上交违法所得，即使部分所得查不清楚，也是符合法律精神的。
二、违法所得具体情况说明
来源与性质：
- 对于查不清楚的违法所得，您应尽可能提供线索或说明其可能来源，如是否与某项业务、交易或活动相关。
- 明确这些所得的性质，是否属于受贿、偷税漏税、非法经营等违法行为产生的。
金额与物品：
- 列出您能够确认的部分违法所得的金额或物品，对于查不清楚的部分，可以说明大致范围或估计值。
- 说明财产形式，如现金、房产、股权等，以及估值方法（如市场价、评估价等）。
时间范围：
- 明确违法行为的起止时间，以及对应收益周期，这有助于司法机关了解违法所得的产生过程。
关联证据：
- 尽管部分所得查不清楚，但您仍应提供尽可能多的关联证据，如流水记录、合同、资产证明等材料清单（如有），以证明您的上交行为是真实且合理的。
三、上交方式与过程
上交途径：
- 您可以通过银行转账、实物移交等方式，将违法所得上交至指定机构，如纪委监委、公安机关、税务部门等。
时间节点：
- 说明您计划分次或一次性上交的日期及对应金额，对于查不清楚的部分，可以说明上交的大致时间或计划。
配合措施：
- 表明您愿意签署承诺书、接受询问笔录、配合审计等，以证明您的上交行为是自愿且配合调查的。
四、态度与承诺
悔过之意：
遵守法律：
- 承诺今后将严格遵守法律法规，不再从事类似违法行为。
整改措施：
- 如涉及单位或企业，需说明内部整改措施，如完善财务制度、加强合规培训等，以防止类似违法行为再次发生。
五、注意事项
真实性：
- 确保您所陈述的内容与提供的证据一致，虚假上交可能构成更严重的法律责任。
时效性：
- 主动上交通常需在司法机关介入前完成，以体现您的主动性和配合度。
法律咨询：
- 在上交前，建议您咨询专业律师，确认上交行为的法律效力和后续风险。
保密性：
- 如涉及个人隐私或商业秘密的内容，可申请部分脱敏处理，以保护您的合法权益。
六、示例说明（针对查不清楚部分）
主动上交部分查不清楚违法所得说明书
致XX机关：
本人XXX（身份证号：XXXXXXXX），在自我反省过程中，发现存在部分违法所得难以查清具体来源和金额。经认真梳理，我确认其中一部分违法所得与XXXX业务/交易/活动相关，但具体数额和细节难以精确回忆。为配合调查、整改并避免法律后果，我愿意主动上交这部分难以查清的违法所得，估计金额为人民币XX万元（或说明财产形式及估值方法）。
具体上交安排如下：
- 已于XXXX年X月X日将能够确认的部分违法所得XX万元存入指定账户（附转账凭证）；
- 剩余难以查清的部分，我计划于XXXX年X月X日前，根据司法机关的指导或要求，以合适的方式完成上交（如提供线索、配合调查等）。
本人郑重承诺：今后将严格遵守法律法规，积极配合后续调查，并接受相应处理。同时，我将加强自我约束，确保不再从事类似违法行为。
说明人：XXX
日期：XXXX年X月X日
通过以上结构化的说明和示例，您可以更清晰地了解如何处理主动上交查不清楚的违法所得问题。希望这些信息能对您有所帮助。