农民占用建设用地临时耕种要求赔偿的问题，主要涉及赔偿款的归属及管理部门的确定，具体分析如下：

1. 赔偿款归属原则

   • 临时占地补偿款的归属并非固定不变，而是需根据土地所有权、土地承包经营权以及地上附着物与青苗的所有权等具体情况来判断。

2. 具体归属与管理部门

   • 土地所有权人角度：
     • 若临时占用的是国有土地，补偿款通常归国家相关管理部门统筹安排使用，如自然资源部门或其下属的土地储备中心等，负责管理和分配补偿款。
     • 若临时占用的是集体土地（如村里的公共用地），补偿款的一部分或全部会归农村集体经济组织所有。此时，管理部门可能是农村集体经济组织本身，或者是其委托的村民委员会等基层自治组织，负责具体分配和使用补偿款。
   • 土地承包经营权人角度：
     • 对于已承包并被临时占用的土地，土地承包经营权人有权获得相应补偿。若土地承包经营权人因占地遭受损失，应向实际占用土地的单位或个人（如建设单位、施工单位等）主张赔偿。若涉及政府征收或集体经济组织统一安排的情况，则可能需通过政府或集体经济组织来协调赔偿事宜。
   • 地上附着物及青苗的所有者角度：
     • 若临时占地涉及到地上附着物（如房屋、树木等）和青苗，其所有者同样有权获得补偿。赔偿事宜通常由实际占用土地的单位或个人与地上附着物及青苗的所有者直接协商确定。若协商不成，可寻求政府相关部门（如自然资源部门、农业农村部门等）的调解或介入。

3. 特殊情况处理

   • 在政府或集体经济组织征收土地但尚未给出明确补偿方案的情况下，若发生临时占用，赔偿款的分配需根据具体的征收协议或相关法律法规来确定。此时，可能涉及政府、集体经济组织和原土地所有者之间的协商和分配，管理部门可能是政府相关部门或集体经济组织。

4. 法律建议

   • 对于农民而言，若因临时占用建设用地而遭受损失，首先应明确自己的土地权益（如土地所有权、土地承包经营权、地上附着物及青苗的所有权等）。
   • 其次，应积极与实际占用土地的单位或个人进行协商，争取获得合理的赔偿。若协商不成，可寻求政府相关部门的调解或介入，必要时可依法提起诉讼来维护自己的合法权益。
   • 在整个过程中，建议农民保留好相关证据（如土地权属证明、地上附着物及青苗的损失证明等），以便在需要时提供有力的支持。

总结来说，农民占用建设用地临时耕种要求赔偿的问题，涉及多个方面的权益和多个管理部门。在处理此类问题时，应综合考虑土地所有权、土地承包经营权以及地上附着物与青苗的所有权等具体情况，并积极与相关部门和单位进行协商和沟通。若遇到难以解决的问题，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。