无证经营医疗器械的违法所得计算，主要依据实际经营活动中所获得的全部收入来确定，并会面临严厉的行政处罚。以下是对此问题的详细解答：
一、违法所得的计算
违法所得，通常指的是无证经营者在未取得合法经营资质的情况下，通过销售医疗器械所获得的全部收入。这包括直接的销售收入，以及可能产生的其他相关收益，如运输费、安装费等（若这些费用已包含在销售价格中，则不再单独计算）。在计算违法所得时，应确保数据的真实性和完整性，以便准确评估违法行为的严重程度。
二、行政处罚措施
根据《医疗器械监督管理条例》的相关规定，无证经营医疗器械将面临以下行政处罚：
没收违法所得和非法财物：
- 负责药品监督管理的部门将没收违法所得，以及违法经营的医疗器械和用于违法经营的工具、设备、原材料等物品。
罚款处罚：
- 违法经营的医疗器械货值金额不足1万元的，并处5万元以上15万元以下罚款。
- 货值金额1万元以上的，并处货值金额15倍以上30倍以下罚款。
- 计算公式（以货值金额1万元以上为例）：
- 罚款金额 = 货值金额 × 罚款倍数（15倍至30倍之间，具体根据情节严重程度确定）
情节严重的额外处罚：
- 若出现经营被依法吊销注册证或生产许可证的医疗器械、造成质量安全事故或其他情节严重的情形，将面临更严厉的处罚，包括责令停产停业、10年内不受理相关责任人及单位提出的医疗器械许可申请、对违法单位的法定代表人等责任人员没收违法行为发生期间自本单位所获收入并处罚款，以及终身禁止其从事医疗器械生产经营活动等。
三、特殊情形的处理
- 如果经营的医疗器械属于未经注册的第二类、第三类医疗器械，但经营企业履行了进货查验等义务，有充分证据证明其不知道所经营的医疗器械为未经注册的，并能如实说明进货来源的，可以免除行政处罚，但经营的未经注册的医疗器械将被收缴。
四、法律建议
- 严格遵守法律法规：企业和个人应严格遵守《医疗器械监督管理条例》等相关法律法规，确保在取得合法经营资质的前提下从事医疗器械的经营活动。
- 加强内部管理：建立健全的内部管理制度，包括进货查验、销售记录等，以便在面临监管检查时能够提供完整的证据链。
- 及时咨询专业律师：若对法律法规存在疑问或面临法律纠纷，应及时咨询专业律师，以便获得准确的法律意见和有效的法律支持。
无证经营医疗器械是一种严重的违法行为，不仅会对公众健康构成潜在威胁，还会扰乱市场秩序。因此，相关部门将依法严厉打击此类行为。如果您或您身边的人涉及此类问题，请直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。