结论：贪污留置后被罚款5万，这通常是因为除了留置这一强制措施外，行为人还需承担贪污行为所带来的行政处罚或刑事处罚中的罚金责任。以下从多个角度进行详细分析：
留置的性质与目的
- 留置是监察机关在调查涉嫌贪污贿赂、失职渎职等严重职务违法或者职务犯罪时，对被调查人采取的一种限制人身自由的强制措施。其目的在于确保调查工作的顺利进行，防止被调查人逃避、妨碍调查或毁灭证据。
- 留置本身并不直接涉及罚款，它是一种强制措施，而非处罚措施。
贪污行为的法律后果
- 贪污行为不仅可能构成犯罪，还可能受到行政处罚。在贪污行为被查实后，行为人除了可能面临刑事追究（如有期徒刑、无期徒刑等）外，还可能根据贪污的数额和情节，受到行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。
- 如果贪污行为构成犯罪，且法院在判决时认为有必要对行为人处以罚金，那么行为人除了被留置外，还可能被判处一定数额的罚金。
罚款5万的可能原因
- 行政处罚：如果贪污行为尚未达到刑事犯罪的标准，但违反了相关行政法规，监察机关或相关行政机关可能根据贪污的数额和情节，对行为人处以罚款。在这种情况下，罚款5万可能是行政机关根据具体情况作出的处罚决定。
- 刑事罚金：如果贪污行为构成犯罪，且法院在判决时认为有必要对行为人处以罚金，那么罚款5万可能是法院根据贪污的数额、情节以及行为人的经济状况等因素综合考量后作出的判决。
法律程序与权利保障
- 在留置期间，被调查人有权委托律师进行辩护，了解自己的权利和义务，以及留置的法律依据和程序。
- 如果行为人对留置或罚款决定有异议，可以通过法律途径进行申诉或复议，以维护自己的合法权益。
建议：如果您或您身边的人因贪污行为被留置并面临罚款，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律程序和权利保障措施。律师可以根据具体情况，为您提供专业的法律意见和辩护策略，帮助您维护自己的合法权益。如有任何法律问题，可以直接向我咨询，我专注于刑事辩护和拆迁安置领域，能够为您提供专业的法律帮助。