结论：工资7000元合同中仅写2360元，余额4640元以奖金形式发放，这种做法是否合法，需根据具体情况来判断，但该做法存在较大的法律风险，很可能被认定为不合法。以下从不同角度进行分析：

一、合同约定与实际发放不符的法律风险

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定劳动者的工资标准、支付方式等关键条款。若合同中约定的工资与实际发放的工资存在显著差异，尤其是当实际发放的工资远高于合同约定时，这种差异可能引发法律纠纷。

1. 合同效力问题：虽然合同是双方自愿签订的，但如果合同中的工资条款与实际发放情况不符，且这种不符并非出于双方的真实意愿（例如，用人单位为了规避法律责任而故意降低合同工资），那么该合同条款可能因存在欺诈、胁迫等情形而被认定为无效或可撤销。

2. 劳动者权益保护：劳动者有权要求用人单位按照实际发放的工资标准支付劳动报酬。如果用人单位仅按照合同约定的低工资标准支付，而拒绝支付实际应得的工资差额，劳动者可以通过法律途径维护自己的合法权益。

二、奖金发放的合法性分析

奖金作为工资的一部分，其发放应当遵循公平、公正、公开的原则，并且应当与劳动者的实际工作表现、贡献等挂钩。如果用人单位将原本应作为固定工资的部分以奖金形式发放，且这种发放方式缺乏合理的依据和标准，那么这种做法可能涉嫌违法。

1. 奖金发放的合理性：奖金的发放应当有明确的规章制度或合同约定作为依据。如果用人单位没有制定合理的奖金发放制度，或者奖金发放与劳动者的实际工作表现、贡献等无关，那么这种奖金发放方式可能被视为不合法。

2. 逃避法律责任的风险：一些用人单位可能试图通过将固定工资拆分为合同工资和奖金两部分来规避法律责任，例如降低用人单位在解除劳动合同、支付经济补偿金等方面的成本。然而，这种做法很可能被劳动仲裁机构或法院认定为不合法，因为用人单位实际上是在通过不正当手段损害劳动者的合法权益。

三、建议与措施

1. 对于劳动者：如果发现自己的工资与合同约定不符，且用人单位以奖金形式发放部分工资，应当及时与用人单位沟通协商，要求用人单位按照实际发放的工资标准修改合同或补发工资差额。如果协商无果，可以向当地劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。

2. 对于用人单位：应当严格遵守相关法律法规，确保劳动合同中的工资条款与实际发放情况一致。如果确实需要发放奖金，应当制定合理的奖金发放制度，并确保奖金的发放与劳动者的实际工作表现、贡献等挂钩。同时，用人单位还应当加强与劳动者的沟通协商，避免因工资问题引发不必要的法律纠纷。

总结来说，虽然用人单位有一定的自主权来决定工资的发放方式和标准，但这种自主权必须在法律法规的框架内行使。将原本应作为固定工资的部分以奖金形式发放，且缺乏合理依据和标准的做法，很可能被认定为不合法。因此，建议用人单位和劳动者都应当严格遵守相关法律法规，确保工资的发放合法、合理、公正。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。