结论：夫妻在感情不合的情况下，仍然可以签订共同开发协议，但需注意协议内容合法、双方意思表示真实且不违反公序良俗，同时建议咨询专业律师以确保协议的有效性和可执行性。

分析说明：

1. 协议签订的合法性基础：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方作为平等的民事主体，有权在自愿、公平、诚实信用的基础上，就共同财产或共同事务签订协议。这种协议，包括共同开发协议，只要内容合法、不违反法律强制性规定，即具有法律效力。

2. 感情不合对协议签订的影响：

   • 感情不合本身并不构成签订共同开发协议的障碍。关键在于双方是否能够就协议内容达成一致，且该协议不损害国家、集体或第三人的利益，不违反公序良俗。
   • 然而，感情不合可能影响双方对协议条款的协商和履行。因此，在签订协议前，双方应充分沟通，明确各自的权利和义务，以避免后续纠纷。

3. 协议签订的建议：

   • 明确协议目的和内容：双方应明确共同开发的具体项目、投资比例、收益分配、风险承担等关键条款，确保协议内容具体、明确、可执行。
   • 咨询专业律师：由于共同开发协议可能涉及复杂的法律问题和财产权益，建议双方在签订前咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
   • 考虑公证或见证：为了增强协议的证明力，双方可以考虑对协议进行公证或邀请第三方见证，以便在后续纠纷中提供有力证据。

4. 可能的风险和后果：

   • 如果协议内容违法或违反公序良俗，该协议可能被认定为无效，双方无法依据协议主张权利。
   • 如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，另一方有权请求撤销协议，并可能要求赔偿损失。
   • 如果双方在履行协议过程中发生纠纷，且无法协商解决，可能需要通过诉讼或仲裁等法律途径解决。

行动建议：

• 如果您和您的配偶在感情不合的情况下考虑签订共同开发协议，建议您首先与对方进行充分沟通，明确各自的需求和期望。
• 接着，您可以咨询专业律师，了解协议签订的法律要求和注意事项，以确保协议的合法性和有效性。
• 在签订协议前，您可以考虑对协议进行公证或邀请第三方见证，以增强协议的证明力。
• 最后，请务必仔细阅读协议条款，确保自己完全理解并同意其中的内容，再行签订。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。