针对您提出的“第二次吸毒主动投案被查获如何处罚”的问题，以下是根据相关法律法规和常见处理流程给出的详细解答：

一、治安处罚

根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第七十二条的规定，对于吸食、注射毒品的行为，将处十日以上十五日以下拘留，并可并处二千元以下罚款；情节较轻的，则处五日以下拘留或者五百元以下罚款。对于第二次吸毒被抓的情况，由于已经有一次吸毒记录，通常会按照较重的标准执行治安拘留和罚款。

二、社区戒毒与强制隔离戒毒

1. 社区戒毒：

   • 若吸毒人员被认定为吸毒成瘾，但尚未达到强制隔离戒毒的程度，公安机关可以责令其接受为期三年的社区戒毒。
   • 在社区戒毒期间，吸毒人员需要遵守相关规定，如定期接受检测、参与康复活动等。若违反协议或再次吸食毒品，将面临更为严厉的处罚。

2. 强制隔离戒毒：

   • 在特定情形下，如拒绝接受社区戒毒、严重违反社区戒毒协议、经社区戒毒后再次吸毒等，公安机关可以直接作出强制隔离戒毒的决定。
   • 强制隔离戒毒的期限一般为二年。但根据戒毒人员的具体情况，执行一年后，经诊断评估，戒毒情况良好的可以提前解除；需要继续执行的，经批准后可以延长一年。

三、其他可能的法律后果

1. 驾驶证问题：吸毒行为可能导致驾驶证被注销或吊销，从而影响个人的交通出行。
2. 刑事责任：虽然单纯的吸毒行为不构成犯罪，但吸毒往往是许多刑事犯罪（如走私、贩卖、运输、制造毒品罪）的诱因或加重情节。若因此触犯刑法，将面临更加严重的刑事处罚。

四、主动投案的影响

虽然您提到的是主动投案，但在法律上，吸毒行为本身已经构成了违法，因此主动投案并不能完全免除法律处罚。不过，主动投案并如实供述自己的行为，通常会被视为自首情节，在量刑时可能会得到一定的从轻或减轻处理。

五、综合考量与执行差异

在实际操作中，各地公安机关会根据吸毒人员的具体情况（如健康状况、是否有自首立功等情节）进行综合判断处理。因此，处罚措施可能因个案而异。

综上所述，第二次吸毒被抓将面临严厉的法律制裁，包括但不限于治安处罚、社区戒毒、强制隔离戒毒以及其他可能的法律后果。强烈建议您远离毒品，珍惜生命和健康，避免再次陷入法律的泥潭。