在违法占地案中，认定非农业用地主要涉及到对土地用途、审批手续以及行为主体行为的综合考量。以下是对这一问题的详细解答：
一、明确非农业用地的定义与范围
非农业用地，通常指的是除农业用地（如耕地、林地、草地等）以外的，用于工业、商业、住宅、交通、水利等非农业建设的土地。在违法占地案中，认定非农业用地，首先要明确土地的实际用途是否与农业用途相悖。
二、审查用地审批手续
未经批准擅自用地：
- 若单位或个人在未获得合法用地审批手续的情况下，擅自占用土地进行非农业建设活动，如建设厂房、住宅等，则该土地可被认定为非法占用的非农业用地。
- 法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第四十四条规定，涉及农用地转为建设用地的，应办理农用地转用审批手续。未经批准占用土地的，属于违法行为。
骗取批准用地：
- 若行为人通过提供虚假材料、隐瞒真实情况等不正当手段，骗取政府有关部门的用地批准，进而进行非农业建设，该土地同样可被认定为非法占用的非农业用地。
- 法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第七十六条规定，采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，将受到法律制裁。
少批多占：
- 若行为人实际占用的土地面积超过批准的用地面积，且超出部分用于非农业建设，则超出部分可被认定为非法占用的非农业用地。
三、分析行为主体的行为与主观意图
行为表现：
- 行为人是否擅自改变土地用途，如将农用地改为建设用地，或进行其他非农业建设活动。
- 行为人是否在临时用地上修建永久性建筑物、构筑物，或临时用地到期后拒不归还。
主观意图：
- 行为人需明知自己占用的是农用地（或原批准用途为农业用地），且未获得合法审批手续，或超出批准范围进行非农业占用。这种故意性是构成非法占用非农业用地（在农用地基础上非法转变用途）的重要主观要件。
四、考察客观后果与数量标准
客观后果：
- 非法占用非农业用地（特别是从农用地转变而来）可能造成土地资源的浪费、生态环境破坏等严重后果。如导致耕地大量毁坏、林地植被破坏等。
数量标准：
- 根据法律规定，非法占用基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上的，即可认定为“数量较大”。若造成耕地大量毁坏等严重后果，则可能面临更严厉的刑罚。这一标准同样适用于从农用地非法转变为非农业用地的情况。
五、结合具体案例与法律法规
以某企业为例，若该企业未经批准擅自在耕地上建设厂房，导致大量耕地被毁坏无法恢复耕种，该企业的行为就构成了非法占用农用地（并转变为非农业用地）的违法行为。法院在判决时，会综合考虑占用土地的面积、造成的损害程度以及行为人的主观恶性等因素，依法作出相应处罚。
六、总结与建议
综上所述，在违法占地案中认定非农业用地，需要综合考量土地用途、审批手续、行为主体行为与主观意图、客观后果与数量标准等多个方面。为确保用地行为的合法性，单位和个人在使用土地时必须严格遵守土地管理法律法规。同时，建议相关部门加强监管力度，提高执法效率，以维护土地市场的秩序和保护土地资源的合理利用。