网签合同的审批部门主要取决于合同的具体类型和所在地区的相关规定。一般来说，网签合同主要涉及到房屋交易，包括商品房预售、存量房买卖等，这些合同的网签备案通常由当地的住房和城乡建设局（或房产管理部门）负责。

以房屋交易合同为例，根据《中华人民共和国城市房地产管理法》以及相关的部门规章和地方性法规，房屋租赁合同或商品房预售合同在签订后，需要向房产管理部门进行登记备案。这一流程确保了合同的合法性和有效性，并保护了交易双方的权益。

具体来说，如果您是在进行商品房预售，开发企业应当与承购人签订商品房预售合同，并在签约之日起30日内，向房地产管理部门和市、县人民政府土地管理部门办理商品房预售合同登记备案手续。如果您是在进行存量房买卖，同样需要在签订买卖合同后，向当地的住房和城乡建设局进行网签备案。

此外，不同地区可能会有一些细微的差别或额外的规定。例如，某些地区可能要求网签合同还需要经过其他相关部门的审批或确认。因此，在实际操作中，建议您最好咨询当地的住房和城乡建设局或房产管理部门，以获取最准确和最新的信息。

总的来说，网签合同的审批部门主要是当地的住房和城乡建设局（或房产管理部门），但具体流程和要求可能因地区和合同类型而有所不同。希望这个解答能够帮助您更好地理解网签合同的审批流程。