在起诉财政局控股的公司时，一般不可以直接将财政局作为被告，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：

一、一般原则：公司独立法人地位

根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。这意味着，财政局控股的公司作为独立的法人实体，其债务和责任应由公司自身承担，而非其股东（包括财政局）直接承担。因此，在一般情况下，起诉财政局控股的公司时，应将该公司作为被告，而非其股东财政局。

二、例外情况：股东滥用权利或公司人格否认

尽管公司具有独立的法人地位，但在某些特定情况下，股东（包括财政局）可能需要对公司债务承担连带责任。这主要发生在股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的情况下。根据《中华人民共和国公司法》第二十条的规定，公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。

具体情形包括但不限于：

1. 股东与公司财产混同：如果财政局作为股东，与公司财产混同，无法区分，那么在公司债务无法清偿时，债权人可以要求财政局对公司债务承担连带责任。
2. 股东过度控制公司：如果财政局过度控制公司，导致公司丧失独立性，成为其工具或傀儡，那么在公司债务无法清偿时，债权人同样可以要求财政局承担连带责任。
3. 股东利用公司进行欺诈或逃避债务：如果财政局利用公司进行欺诈行为或逃避债务，严重损害债权人利益，那么债权人也有权要求财政局对公司债务承担连带责任。

三、实际操作建议

1. 明确被告身份：在起诉前，应明确被告的身份。如果目标是追究公司的责任，那么应将公司作为被告；如果认为股东（包括财政局）存在滥用权利或公司人格否认的情形，且希望追究其连带责任，那么可以在起诉公司的同时，将股东列为共同被告或第三人。
2. 收集证据：在起诉前，应充分收集证据，证明股东存在滥用权利或公司人格否认的情形。这包括但不限于公司财务记录、股东控制公司的证据、欺诈或逃避债务的证据等。
3. 咨询专业律师：由于涉及复杂的法律问题和证据收集，建议在起诉前咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。

如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。