关于药房从诊所有开流转处方是否合法的问题，这主要取决于具体的处方流转管理规定以及实际操作是否符合相关要求。

首先，我们需要明确处方流转的基本概念。处方流转是指将医院或诊所医生开出的医保药品外配处方，通过合法平台流转到相关的定点药店，以便患者能够在药店购买该药品。这一流程的初衷是为了更好地保障参保人的用药可及性，确保参保群众能够及时获得所需的药品。

接下来，我们根据国家医保局的相关规定来分析这个问题：

1. 处方流转的合法性：国家医保局支持合理的医保药品外配处方，并强调要加强处方流转全流程的监管，以严厉打击虚假处方欺诈骗保行为。这意味着，只要处方流转过程符合规定，就是合法的。

2. 处方流转的具体要求：

   • 对于能够电子处方流转的地区，应按照电子方式进行，以提高流转效率和准确性。
   • 对于只能使用纸质处方的地区，必须做好监管和留存工作，确保处方的真实性和可追溯性。
   • 纸质处方应由定点医疗机构按照相关部门规定的标准和格式印制，并进行连续编号，以保证处方编号的唯一性和可识别性。
   • 定点医疗机构要将涉及参保人的所有外配处方留存备查，保存期限不少于2年。

3. 关于诊所开出的流转处方：

   • 如果诊所是定点医疗机构，并且其开出的处方符合上述要求，那么这些处方是可以流转到药房的。
   • 药房在接收流转处方时，应认真检查处方的真实性、合法性、规范性，核准处方用药信息、有效期等以及参保人信息。如果发现问题，药房可以拒绝调剂，并及时向当地医保部门反映存疑外配处方线索。

4. 跨统筹地区流转的限制：

   • 原则上，定点零售药店凭本统筹地区定点医疗机构外配处方销售的药品，符合规定的可以纳入医保统筹基金支付范围。
   • 暂不接受本统筹地区以外的医疗机构外配处方，这是为了防止虚假处方和欺诈骗保行为的发生。

综上所述，药房从诊所接收流转处方是合法的，但前提是诊所必须是定点医疗机构，且开出的处方符合国家医保局的相关规定。同时，药房在接收处方时也需要进行严格的审核和监管，以确保处方的真实性和合法性。如果在实际操作中遇到任何问题或疑虑，建议及时向当地医保部门咨询或举报。