公司在作为被告诉讼期间，并非绝对不能注销，但注销过程需严格遵循法定程序，并妥善处理所有未了结的诉讼，否则将面临严重的法律责任和后果。以下是对此问题的详细分析：
一、法律允许注销的情况与限制
清算组的责任：
- 公司决定在诉讼期间注销时，必须成立清算组，全面清理公司的债权债务。清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内进行公告。对于正在进行的诉讼所涉及的潜在债务，清算组必须妥善处理，确保债权人的合法权益不受损害。
诉讼的处理方式：
- 合法清算并注销：若公司经过合法的清算程序后注销，且清算过程中已妥善处理了所有未了结的诉讼，则通常意味着其民事主体资格消灭。但需注意，若存在恶意处置公司财产或虚假的清算报告等情形，原告仍可申请变更诉讼主体，要求相关责任人承担赔偿责任。
- 未经依法清算即注销：若公司未经依法清算即办理注销登记，债权人可以主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。此外，法院也可能对公司进行恢复，并继续追究其法律责任。
实际操作中的限制：
- 虽然法律上并未明确禁止公司在诉讼被告期间注销，但实际操作中，法院往往会要求公司在注销前清理和了结所有涉及公司的民事诉讼。因此，公司在面临诉讼时，应积极应对、妥善处理，以避免因注销而引发的法律风险和经济损失。
二、注销后的法律后果及责任承担
民事责任承担：
- 公司注销后，其法人资格终止，一般情况下不再承担民事责任。但若存在股东、实际控制人等未依法履行清算义务导致公司财产流失、无法清偿债务等问题，相关责任人需承担相应的民事赔偿责任。
对诉讼程序的影响：
- 如果公司在诉讼过程中注销且已合法清算并注销，法院可能会裁定终结诉讼。
- 若公司存在未依法清算等问题，法院可能会根据原告的申请变更股东、实际控制人等相关责任人为被告，继续审理案件。
恶意注销的法律风险：
- 若公司在被告期间恶意注销以逃避法律责任，相关责任人可能会面临法律追究，如被列为失信被执行人等严重后果。
三、综合建议
谨慎决策：
- 公司在作为被告时决定注销应极其谨慎，确保注销行为的合法性和合规性。在注销前，公司应充分评估诉讼纠纷的解决情况、清算工作的进展以及债务清偿能力等因素。
积极应对诉讼：
- 在诉讼期间，公司应积极配合诉讼进程，确保诉讼事项得到妥善处理。若确需注销，应先与债权人协商解决诉讼纠纷，或待诉讼终结后再行申请。
严格遵守法定程序：
- 在注销过程中，公司应严格按照法定程序进行清算、公告和注销登记等手续，确保所有未了结的诉讼得到妥善处理。
寻求专业法律帮助：
- 鉴于注销过程的复杂性和法律风险，建议公司在决定注销前咨询专业律师，以获取更具体的法律意见和指导。
总之，公司在作为被告诉讼期间注销需谨慎操作，并严格遵守相关法律法规和程序规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。