当取保候审人在取保候审期间死亡，其刑事诉讼程序将终止，同时需妥善处理保证金退还及民事赔偿等相关问题。以下从刑事诉讼程序、保证金退还、民事赔偿及特殊情形处理四个方面进行详细阐述：
一、刑事诉讼程序方面
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关规定，取保候审期间犯罪嫌疑人、被告人死亡，刑事诉讼程序将按以下方式处理：
侦查阶段：若案件处于侦查阶段，公安机关应撤销案件，并解除对相关财物的查封、扣押、冻结等措施。因为犯罪主体已不存在，继续侦查无实际意义。
审查起诉阶段：案件移送至检察机关审查起诉时，若犯罪嫌疑人死亡，人民检察院应依法作出不起诉决定。此属于法定不起诉情形，案件不再向法院提起公诉。
审判阶段：若案件已进入法院审判阶段，被告人死亡，人民法院一般应裁定终止审理。但若能根据已查明的案件事实和证据确认被告人无罪，人民法院应判决宣告被告人无罪。
此外，一旦得知被取保候审人死亡，执行机关应立即报告决定机关，决定机关需核实死亡原因，并依法撤销取保候审，终止案件审查，通知原办案机关、家属、保证人等相关当事人和单位。
二、保证金退还
犯罪嫌疑人、被告人在取保候审期间需缴纳一定数额的保证金。当其死亡导致取保候审解除时，其亲属可凭解除取保候审的通知或相关法律文书到银行领取退还的保证金。这一流程确保了保证金能够及时、准确地退还给合法继承人，避免了不必要的纠纷。
三、民事赔偿问题
若犯罪行为给被害人造成了物质损失，被害人及其家属可通过民事诉讼要求犯罪嫌疑人、被告人的继承人在继承遗产范围内承担民事赔偿责任。依据《中华人民共和国民法典》，继承人以所得遗产实际价值为限清偿债务。这意味着，如果犯罪嫌疑人、被告人有遗产，其继承人需要在继承遗产的范围内赔偿被害人的损失；如果遗产不足以赔偿全部损失，继承人则无需承担超出遗产实际价值部分的赔偿责任。
四、特殊情形处理
因病死亡：若被取保候审人因病死亡，执行机关应及时通知其家属领取遗体并处理丧事，同时将死亡情况和处理结果记录在案。这一规定体现了对死者及其家属的尊重和关怀。
涉嫌故意实施新的犯罪行为：若在取保候审期间，被取保候审人涉嫌故意实施新的犯罪行为，虽已死亡，但仍应对其生前行为进行追诉和审判。不过，由于犯罪嫌疑人已死亡，无法再对其进行刑事处罚，但可以对其生前行为进行法律评价，并依法处理相关财产和民事赔偿问题。具体处理需根据法律规定和实际情况判断，确保法律的公正和权威。
综上所述，取保候审期间犯罪嫌疑人、被告人死亡的处理方式需严格遵循相关法律法规，确保程序的合法性和公正性。同时，也需灵活处理各方合法权益，确保法律知识的准确应用和实际操作的可行性。如果您或您身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。