结论：不动产登记中心以需征得原单位同意为由不配合办理法拍房过户，这一做法是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下，若无法律明确规定需原单位同意，则不动产登记中心的做法不合法。以下从不同角度进行分析：

一、法拍房过户的一般原则

法拍房，即法院拍卖的房产，其过户流程通常遵循一般的房产过户原则，即依据相关法律法规，完成产权转移登记手续。在正常情况下，法拍房的过户不需要征得原产权单位（或原业主）的同意，因为拍卖过程已经通过法律程序确认了新的产权人。

二、不动产登记中心的职责与权限

不动产登记中心的主要职责是依据相关法律法规，对不动产的产权进行登记、变更、注销等操作。其权限来源于法律法规的明确规定，而非自行设定。因此，不动产登记中心在办理过户时，必须严格遵循法律法规的规定，不得擅自增加过户条件或要求。

三、需征得原单位同意的特殊情况

尽管一般情况下法拍房过户不需要征得原单位同意，但也存在一些特殊情况，如：

1. 法律法规有明确规定：如果相关法律法规明确规定，在特定情况下（如涉及国有资产、集体资产等）需要征得原单位或相关部门的同意才能办理过户，那么不动产登记中心的要求就是合法的。但这种情况较为少见，且必须依据具体的法律法规来判断。
2. 法院拍卖公告或裁定中有特别约定：在法院拍卖房产时，拍卖公告或裁定中可能会包含一些特别约定，如要求买受人承担某些特定义务或满足某些特定条件才能办理过户。如果这些特别约定中包含了需要征得原单位同意的内容，那么不动产登记中心的要求也是合法的。但这种情况同样需要依据拍卖公告或裁定的具体内容来判断。

四、不动产登记中心做法的合法性判断

在大多数情况下，如果无法律法规的明确规定或法院拍卖公告、裁定中的特别约定，不动产登记中心以需征得原单位同意为由不配合办理过户，则可能构成违法。因为这一要求超出了其法定职责和权限范围，且没有法律依据支持。

五、建议与措施

如果您遇到不动产登记中心以需征得原单位同意为由不配合办理过户的情况，您可以采取以下措施：

1. 核实法律法规：首先核实相关法律法规是否有明确规定需要征得原单位同意才能办理过户。如果没有，您可以向不动产登记中心提出异议，并要求其依据法律法规办理过户手续。
2. 查看拍卖公告或裁定：查看法院拍卖公告或裁定中是否有特别约定需要征得原单位同意的内容。如果没有，您可以向法院或拍卖机构反映情况，并要求其协助办理过户手续。
3. 寻求法律援助：如果不动产登记中心仍然拒绝办理过户手续，您可以寻求法律援助或咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益。

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