两轮电动车改电池仓是否违法，需分情况讨论，具体如下：
若改装行为符合相关安全标准与规定：
- 在不改变电动车原有结构、性能，且确保改装后的电池仓符合国家关于电动车安全技术标准的前提下，改装电池仓可能并不直接构成违法。但这种情况较为特殊，因为大多数改装行为往往难以完全符合原厂设计的安全标准。
若改装行为违反相关安全标准与规定：
- 违反安全技术标准：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，电动车的设计、制造和改装需符合国家安全技术标准。若改装电池仓导致电动车的结构、性能发生变化，如电池容量过大、电池仓位置改变影响车辆平衡等，从而不符合安全技术标准，则可能被视为违法行为。
- 非法改装认定：非法改装通常指的是未经许可，擅自改变车辆的结构、构造或者特征，包括改变车辆类型、用途、车身颜色、外观尺寸，以及更换发动机、变速器、车架等主要部件等。若改装电池仓被认定为非法改装，则可能面临法律责任。
- 法律后果：对于非法改装电动车的行为，公安机关交通管理部门有权责令恢复原状，并可能处以罚款。若改装后的电动车因安全问题导致交通事故，改装者还可能承担相应的民事赔偿责任，甚至刑事责任（如构成交通肇事罪等）。
法律建议：
- 避免非法改装：为了自身和他人的安全，建议电动车车主不要擅自改装电池仓或其他部件。若需更换电池或进行其他维修，应选择正规的维修站点，并确保使用符合安全标准的配件。
- 了解相关法规：车主应主动了解并遵守国家关于电动车安全技术标准的相关规定，以及当地关于电动车管理的具体法规。
- 及时咨询：若对电动车的改装或使用有疑问，建议及时咨询当地交通管理部门或专业律师，以获取准确的法律意见。
总结：两轮电动车改电池仓是否违法，取决于改装行为是否符合相关安全标准与规定。为了自身和他人的安全，建议车主避免非法改装，并主动了解并遵守相关法规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。