保函保证金不属于票据保证金，二者在性质、用途及法律关系上存在明显区别，具体分析如下：
定义与性质差异
保函保证金是申请人（如企业）向银行或担保机构缴纳的，用于担保保函项下义务履行的资金，其本质是担保性质的资金，目的是确保保函受益人在申请人违约时能获得补偿。而票据保证金是票据申请人（如出票人）为开具银行承兑汇票或信用证等票据，按约定比例存入银行的资金，属于票据业务的信用保障措施，用于确保票据到期时银行能无条件兑付。
用途与法律关系不同
保函保证金直接关联保函的履行，若申请人未履行保函义务，银行或担保机构有权直接扣划保证金用于赔付；若保函未触发赔付，保证金通常在保函到期后返还。票据保证金则用于支撑票据的信用，若票据到期时申请人账户资金不足，银行会优先从保证金中划扣兑付；若票据正常兑付，保证金会返还或转为其他用途。二者的法律关系分别基于担保合同和票据法律关系，适用规则不同。
监管与适用场景
保函保证金受《民法典》中担保物权相关规定约束，常见于工程承包、贸易合同等场景，用于担保合同履行。票据保证金则受《票据法》及银行内部规定调整，主要用于商业票据的信用增强，如银行承兑汇票、信用证等。二者在监管框架和适用场景上完全独立。
总结：保函保证金与票据保证金虽均为“保证金”，但因性质、用途及法律关系不同，属于两类独立的金融担保措施，不可混同。若您涉及具体业务中保证金性质认定或纠纷，可进一步向我咨询细节。