结论：故意损坏他人财物价值1000元，即使愿意赔偿，是否会被扣留需视具体情况而定，但一般情况下，若情节轻微且愿意赔偿，可能不会面临行政拘留；若情节严重或存在其他恶劣情形，则可能面临行政拘留。
分析说明：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第四十九条的规定，故意损毁公私财物的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款。这一条款明确了故意损坏他人财物的法律后果，包括可能的行政拘留和罚款。
情节轻微的情况：
- 如果故意损坏的财物价值相对较低（如1000元），且行为人愿意主动赔偿损失，且没有其他恶劣情节（如多次实施此类行为、对受害人造成严重精神损害等），那么根据治安管理处罚法的相关规定，公安机关可能会考虑从轻或减轻处罚，甚至可能不给予行政拘留的处罚，而是采取警告、罚款等更轻微的处罚措施。
情节严重的情况：
- 如果故意损坏财物的行为情节严重，如多次实施、损坏财物价值较高（虽然1000元可能不构成刑事犯罪，但若与其他情节结合可能构成）、对受害人造成严重精神损害或社会影响恶劣等，那么即使行为人愿意赔偿，也可能面临行政拘留的处罚。此外，如果损坏的财物具有特殊价值或意义（如文物、纪念品等），或者行为人存在其他违法犯罪行为（如盗窃后损坏财物等），那么处罚可能会更加严厉。
特殊场景：
- 在某些特殊情况下，如行为人系未成年人、精神病人或存在其他法定从轻、减轻处罚的情形时，公安机关可能会根据具体情况对处罚进行适当调整。例如，对于未成年人或精神病人实施的故意损坏财物行为，如果情节轻微且愿意赔偿，公安机关可能会更多地采取教育、引导等非处罚性措施。
行动建议：
- 主动赔偿与道歉：如果发生了故意损坏他人财物的情况，建议行为人主动与受害人联系，表达歉意并愿意赔偿损失。这有助于缓解矛盾、减少社会影响，并可能对公安机关的处罚决定产生积极影响。
- 配合调查与处理：在公安机关介入调查时，行为人应积极配合调查工作，如实陈述事实、提供证据等。这有助于公安机关查明事实真相、作出公正处理决定。
- 寻求法律帮助：如果行为人对公安机关的处罚决定存在异议或需要法律帮助时，可以及时向专业律师咨询并寻求法律援助。律师将根据具体情况为行为人提供法律建议、代理申诉或提起行政诉讼等法律服务。
法律后果：
- 如果行为人因故意损坏他人财物而被行政拘留，这将对其个人声誉、工作和生活等方面产生不良影响。因此，建议行为人遵守法律法规、尊重他人财产权益，避免实施此类违法行为。