两个孩子是可以做亲子鉴定的。亲子鉴定是通过比对分析基因序列，来判断两个人之间是否存在亲子关系的一种科学方法。在婚姻家庭领域，亲子鉴定有时用于解决关于孩子亲生父母身份的争议。

亲子鉴定的类型

1. 个人隐私亲子鉴定：这种鉴定通常是为了满足个人对亲子关系的确认需求，不涉及法律程序。它可以帮助人们了解真相，解决家庭内部的疑虑或纷争。
2. 司法亲子鉴定：这种鉴定具有法律效力，通常用于解决遗产继承、抚养权纠纷等法律问题。进行司法亲子鉴定时，需要遵循严格的法律程序和规定。

亲子鉴定的流程

1. 选择鉴定机构：选择一家具有正规资质和良好信誉的亲子鉴定机构。
2. 提交样本：根据鉴定机构的要求，提交被鉴定人的样本（如血液、毛发、口腔黏膜细胞等）。
3. 样本检测：鉴定机构对提交的样本进行基因检测，分析基因序列。
4. 出具鉴定报告：根据基因检测结果，鉴定机构出具亲子鉴定报告，明确说明两个人之间是否存在亲子关系。

注意事项

1. 保护隐私：在进行亲子鉴定时，应尊重被鉴定人的隐私权，避免泄露个人信息。
2. 遵循法律程序：如果需要司法亲子鉴定，务必遵循相关法律程序和规定，以确保鉴定结果的法律效力。
3. 谨慎选择机构：选择亲子鉴定机构时，应仔细了解其资质和信誉，避免遭遇欺诈或虚假鉴定。

综上所述，两个孩子是可以做亲子鉴定的，但具体选择哪种类型的鉴定以及如何进行鉴定，需要根据实际情况和需求来决定。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。