结论前置：交警使用摩托车在不同地方对同一车辆一天内拍摄两次违停，是否会被罚款两次，需分情况讨论，具体如下：
- 若两次违停行为均独立构成违法事实
根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》第五十二条，对同一违法行为不得重复处罚，但不同时间、不同地点的违停属于独立违法行为。例如：
- 上午9点在A路段违停被拍摄，下午3点在B路段再次违停被拍摄，两次行为间隔时间较长且地点不同，交警可分别处罚，即罚款两次。
- 法律依据：《行政处罚法》第二十九条明确，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚，但“同一个违法行为”需满足时间、地点、行为方式等要素高度重合。若要素不同，则视为独立违法行为。
- 若两次拍摄针对同一违停行为（如车辆未移动）
若车辆在同一地点持续违停，交警因技术原因（如摩托车巡逻分时段拍摄）多次拍摄，但违停状态未改变，则属于同一违法行为，只能处罚一次。
- 例如：车辆从上午8点停至下午2点未移动，交警上午10点和下午1点分别拍摄，只能按一次违停处罚。
- 法律依据：同上《行政处罚法》第二十九条，避免重复处罚原则。
- 特殊情形：部分城市有“首违免罚”或“限时免罚”政策
部分地区对首次违停或短时间（如10分钟内）驶离的违停行为免于处罚，但需满足以下条件：
- 车辆未造成交通堵塞或事故；
- 车主无其他交通违法记录；
- 具体政策以当地交管部门规定为准。
- 例如：深圳市对首次违停且10分钟内驶离的，可免于罚款，但需通过“星级用户”平台申报。
建议：
- 若收到两张罚单，可先核对违停时间、地点是否一致，若为同一行为，可申请行政复议或提起行政诉讼要求撤销重复处罚；
- 日常停车时注意观察禁停标志，避免因疏忽导致多次违停；
- 如有疑问，可直接向我咨询具体地区的违停处罚规则及应对策略。