政府出借资金给民营企业后收回资金的处理方式需根据资金性质、出借程序及合同约定综合判断，核心结论如下：
若资金属于政策性扶持资金（如产业扶持、纾困资金）
- 合同约定优先：需审查政府与民营企业签订的借款合同或扶持协议，明确资金性质（无偿资助、低息贷款或需偿还的借款）、还款期限、利息计算方式及违约责任。若合同明确约定资金需偿还，政府可依据合同通过协商、催告或诉讼程序收回资金；若为无偿资助，则无需收回，但企业可能需满足特定条件（如税收、就业指标）。
- 程序合法性审查：若资金出借未履行法定程序（如未经财政部门审批、未纳入预算管理），可能被认定为违规出借，此时政府需先通过内部整改程序补正手续，再依法主张权利，否则可能面临行政诉讼风险。
若资金属于临时周转性借款（如应急转贷资金）
- 按合同约定收回：此类借款通常明确还款期限及利息，政府可依据合同要求企业按期还款。若企业逾期未还，政府可发送催告函，协商延期或分期还款；协商无果的，可向法院提起民事诉讼，申请财产保全或强制执行。
- 风险防控措施：为保障资金安全，政府可在出借时要求企业提供担保（如抵押、质押或保证），并在合同中约定违约责任（如加收罚息、提前收回借款）。若企业已提供担保，政府可优先通过处置担保物实现债权。
若资金出借存在违规情形（如未履行招投标程序、利益输送）
- 内部追责与整改：政府需先对出借行为进行内部审查，确认是否存在违规操作或腐败问题。若存在，需对相关责任人追责，并整改出借程序（如补办审批手续、公开资金使用情况）。
- 资金收回的合法性：即使出借程序违规，政府仍可依据实际借贷关系主张权利，但需注意避免以违规手段催收（如滥用行政权力强制扣款），否则可能引发行政复议或诉讼。
实务建议：政府在出借资金前应完善合同条款，明确资金性质、还款方式及违约责任；出借后需加强资金监管，定期跟踪企业还款能力；收回资金时优先通过协商解决，协商无果的及时启动法律程序，避免诉讼时效过期。若涉及复杂情形（如企业破产、资金链断裂），建议结合《民法典》《预算法》及地方财政管理规定综合处理。
如有具体案件细节或合同文本需要分析，可直接向我提供，我将进一步结合事实与法律条款给出针对性建议。