小产权房在民事纠纷判决后是否会被冻结，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、小产权房的法律性质
小产权房，通常指的是在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，亦称“乡产权房”。由于小产权房并未获得国家法律认可的完整产权，因此在法律上，其处置方式与具有完整产权的房屋存在显著差异。
二、民事纠纷判决与财产冻结的关系
在民事纠纷中，如果一方当事人未履行法院判决或裁定的义务，另一方当事人可以向法院申请强制执行。在强制执行过程中，法院有权对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施，以确保判决或裁定的有效执行。然而，这一措施主要针对的是被执行人具有明确产权的财产。
三、小产权房是否会被冻结的具体分析
若小产权房被认定为被执行人的合法财产：
- 尽管小产权房的产权证不是由国家房管部门颁发，但如果法院在执行过程中，基于某种原因（如双方认可、地方政策等）认定该小产权房为被执行人的合法财产，那么法院有权对其进行冻结或采取其他强制执行措施。但这种情况相对较少，且往往涉及复杂的法律和政策考量。
若小产权房不被认定为被执行人的合法财产：
- 在大多数情况下，由于小产权房的法律地位不明确，法院可能不会直接将其视为被执行人的合法财产进行冻结。但这并不意味着被执行人可以完全规避执行，法院可能会通过其他方式（如限制被执行人的其他财产、限制其高消费等）来促使被执行人履行义务。
特殊情况下的处理：
- 在某些地区，由于地方政策或司法实践的差异，法院可能会对小产权房采取特殊的处理方式。例如，一些地方可能允许对小产权房进行拍卖或变卖，但所得款项可能不会直接用于清偿债务，而是用于其他特定目的（如补偿集体经济组织等）。
四、法律建议
对于小产权房的买卖或纠纷处理：
- 由于小产权房的法律地位不明确，建议当事人在进行买卖或处理相关纠纷时，务必谨慎行事。最好咨询专业律师的意见，以了解当地政策和司法实践，避免不必要的法律风险。
面对民事纠纷判决后的执行问题：
- 如果您是小产权房的所有人或相关当事人，且面临民事纠纷判决后的执行问题，建议您积极与法院沟通，了解法院的执行意图和措施。同时，您也可以考虑通过合法途径（如提供担保、协商和解等）来避免或减轻执行措施对您的影响。
如有任何关于房产纠纷或其他法律问题的疑问，欢迎直接向我咨询。