公司一般不可以随意组织在职员工进行乙肝检查，但在特定情况下可以组织。以下从不同角度进行分析：
一、一般情况下的禁止性规定
根据《就业促进法》以及相关劳动法律法规的规定，用人单位招用人员，除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止乙肝病原携带者从事的工作外，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。这意味着，在一般情况下，公司不得以乙肝检查作为员工体检的常规项目，也不得因员工是乙肝病原携带者而拒绝录用或解除劳动合同。
二、特定情况下的允许性规定
尽管有上述禁止性规定，但在某些特定情况下，公司组织乙肝检查可能是被允许的。这些特定情况主要包括：
- 特殊岗位需求：如果员工从事的是国家法律、行政法规和卫生部规定禁止乙肝病原携带者从事的工作，如食品加工、餐饮服务、幼教等，那么公司可以组织乙肝检查，以确保员工符合岗位的健康要求。
- 员工自愿检查：如果员工自愿进行乙肝检查，并且公司没有强迫或诱导员工进行检查，那么这种检查是合法的。但公司应当尊重员工的隐私权，不得将检查结果作为歧视或解雇员工的依据。
三、法律后果与建议
- 法律后果：如果公司违反规定，强行组织员工进行乙肝检查，或者因员工是乙肝病原携带者而拒绝录用、解除劳动合同，那么员工有权向劳动监察部门投诉，要求公司承担相应的法律责任。同时，公司还可能面临行政处罚和民事赔偿等法律后果。
- 建议：为了避免法律风险，公司应当遵守相关法律法规的规定，不得随意组织员工进行乙肝检查。如果确实需要了解员工的健康状况，可以选择其他不涉及乙肝检查的体检项目。同时，公司应当加强员工的健康教育和宣传，提高员工对乙肝等传染病的认识和防范意识。
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