结论：同一集体经济组织但不同自然村之间买卖宅基地建房，其合法性并非绝对，而是取决于多种因素，包括买卖双方的身份、宅基地及房屋的合法性以及是否经过相关审批程序。一般情况下，若未经合法程序审批，此类买卖行为可能面临法律风险。以下是对此问题的详细分析：

一、宅基地所有权与流转限制

宅基地的所有权归农村集体所有，而非个人。根据《土地管理法》及相关政策规定，宅基地的转让通常限定在本集体经济组织成员之间。这里的“本集体经济组织成员”一般指的是同一自然村或同一行政村内的村民。因此，同一集体经济组织但不同自然村的村民之间买卖宅基地，若未经特定审批程序，可能并不符合宅基地流转的常规限制。

二、合法买卖的条件

尽管同一集体经济组织内不同自然村之间的宅基地买卖可能面临限制，但在某些特定条件下，此类买卖仍可能被视为合法。这些条件包括：

1. 买卖双方身份合法：买卖双方必须均为同一集体经济组织成员，即虽然自然村不同，但均属于同一行政村或更高级别的集体经济组织。
2. 宅基地及房屋合法：买卖的宅基地及地上房屋必须合法，无任何法律纠纷或违法建设情况。
3. 经过审批程序：宅基地的买卖必须经过本集体经济组织的同意，并可能需经过相关政府部门的审批。这一程序旨在确保宅基地的流转符合集体整体利益和规划要求。

三、非法买卖的法律后果

若同一集体经济组织但不同自然村的村民之间未经合法程序买卖宅基地建房，可能面临以下法律后果：

1. 合同效力问题：此类买卖合同可能因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效合同。一旦合同无效，双方需相互返还财产，购房者需返还宅基地及地上房屋，出售方需返还购房款。
2. 产权登记难题：购房者可能无法办理宅基地使用权证以及房屋产权证书，因此无法获得合法的物权保障。在遇到拆迁、征收等情况时，难以维护自己的权益。
3. 土地用途管制违规：宅基地是专门用于农村村民居住的集体建设用地，非法买卖宅基地建房可能导致土地用途的不当改变，扰乱农村土地管理秩序，并可能面临相关部门的处罚。

四、特殊情况与建议

尽管一般情况下同一集体经济组织但不同自然村的村民之间买卖宅基地建房可能面临法律风险，但也存在一些特殊情况和例外规定。例如，若因合法继承房屋而获得宅基地使用权，或符合当地政策规定的特定条件并经过严格审批程序后，有可能合法取得宅基地及地上房屋。

建议：对于有意进行此类买卖的村民，务必先了解清楚相关法律规定和政策要求，确认自己的资格和买卖程序的合法性。在交易过程中，建议详细审查买卖双方的主体资格、宅基地及房屋的合法性以及是否经过相关审批程序。如有任何疑问或不确定之处，可直接向我咨询，以确保交易的合法有效性和避免未来可能出现的纠纷。