全勤奖作为奖金的一种形式，应包含在工资总额内，但不属于基本工资范畴。以下是对这一问题的详细分析：
一、全勤奖的性质与归属
全勤奖是用人单位为激励员工保持全勤、提高工作积极性和效率而设立的一种奖励制度。它基于员工的正常出勤和劳动付出，是对员工工作表现的一种额外报酬。从性质上讲，全勤奖属于奖金范畴，是工资总额的一个组成部分。
二、工资总额的组成与全勤奖的计入
根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额是指各单位在一定时期内直接支付给本单位全部职工的劳动报酬总额，这其中包括了奖金。全勤奖作为奖金的一种，自然应计入工资总额。因此，从广义上讲，全勤奖是包含在工资里面的。
三、全勤奖的发放与扣除
发放标准与条件：全勤奖的发放标准和条件由用人单位自行决定，通常会与员工的出勤情况、工作任务完成情况等挂钩。如果员工未达到全勤奖的发放条件，用人单位有权不予发放。但全勤奖的发放需遵循公平、公正的原则，不得违反相关法律法规和劳动合同约定。
扣除与赔偿：如果员工因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。在这种情况下，经济损失的赔偿可以从员工的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。这里的“工资”指的是包括基本工资、奖金（如全勤奖）等所有劳动报酬的总和。
四、法律保障与劳动者权益
用人单位在计算加班工资基数、经济补偿金等涉及工资相关的项目时，应将全勤奖作为工资的一部分予以考虑。如果用人单位故意不将全勤奖计算在内，可能构成违法行为，劳动者有权通过合法途径维护自身权益，包括但不限于向劳动监察部门投诉、提起劳动仲裁或诉讼等。
五、实际案例与建议
在实际操作中，有些用人单位可能会将全勤奖作为单独的一项福利进行发放，而不将其计入工资总额。然而，这种做法并不符合法律法规的规定。劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，了解全勤奖的发放与扣除规定，确保自己的权益得到保障。如果用人单位存在违法行为，劳动者应及时向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，全勤奖作为奖金的一种形式，虽然不属于基本工资范畴，但应包含在工资总额内。其发放与扣除需严格遵循劳动合同、单位规章制度及相关法律法规。如果您在全勤奖的发放与扣除过程中遇到任何问题，或者有任何法律疑问，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。