要认定非法运营，必须具备的证据主要包括以下几个方面：
主体证据：
- 需证明实施非法运营行为的主体，这通常包括个人或企业的身份信息，如身份证、营业执照等，以确认运营者的身份和资格。
运营行为证据：
- 车辆运营证据：对于涉及车辆运营的非法行为，需要提供车辆的相关信息，如车辆行驶证、车牌号、车辆照片等，以证明车辆的存在及其使用情况。
- 运营活动记录：包括运营的时间、地点、路线、载客或载货情况等，这些可以通过行车记录仪、乘客或货主的证言、交易记录等方式来证明。例如，在非法客运中，可以收集乘客的乘车记录、支付凭证等作为证据。
- 运营收入证据：非法运营往往以获取经济利益为目的，因此需要提供运营收入的证据，如银行转账记录、现金收据、交易合同等，以证明运营活动的盈利性。
非法性证据：
- 缺乏合法资质证据：证明运营者未取得相关行政主管部门核发的运营证件或超越核定范围进行运营，如未取得道路运输经营许可证、网络预约出租汽车经营许可证等。
- 违反规定证据：证明运营活动违反了相关法律法规或规章制度，如违反了客运、货运、出租车运营等方面的管理规定。这可以通过相关部门的处罚决定书、整改通知书等文件来证明。
其他辅助证据：
- 证人证言：包括乘客、货主、同行运营者等的证言，他们可以提供关于运营活动的直接或间接信息。
- 视听资料：如监控录像、录音等，可以直观地展示运营活动的实际情况。
- 电子数据：如手机短信、微信聊天记录、电子邮件等，这些电子数据可能包含关于运营活动的关键信息。
在收集证据时，需要注意以下几点：
- 证据的合法性：确保所收集的证据是合法取得的，不侵犯他人的合法权益，如隐私权、肖像权等。
- 证据的完整性：尽量收集完整的证据链，以全面、客观地反映运营活动的实际情况。
- 证据的及时性：在发现非法运营行为后，应及时收集证据，以免证据灭失或难以取得。
若您怀疑某主体存在非法运营行为，并希望进行举报或采取法律措施，建议您：
- 首先，尽可能详细地收集上述各类证据，以确保举报或诉讼的准确性和有效性。
- 其次，可以向相关行政主管部门（如交通运输管理部门）进行举报，由他们进行调查和处理。
- 最后，如果涉及法律纠纷或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。