结论：对方以贪污所得资金出具欠条，后起诉你诈骗能否要回款项，需分情况讨论，关键在于资金性质、欠条合法性及是否存在诈骗事实。以下从不同角度分析：

一、若欠条合法有效，且无诈骗事实

1. 资金性质不影响欠条效力：贪污所得属于违法所得，但根据《民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效的条件为行为人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或公序良俗。若欠条是双方真实意思表示，且无其他违法情形（如胁迫、欺诈），即使资金来源违法，欠条本身仍可能被认定为有效。此时，对方起诉你诈骗，若无法证明你存在虚构事实、隐瞒真相等诈骗行为，法院不会支持其返还请求。
2. 违法所得的追缴与欠条无关：根据《刑法》第六十四条，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或责令退赔。但追缴对象是犯罪分子本人，而非善意第三人。若你不知资金来源违法，且欠条合法，对方作为贪污犯罪嫌疑人，其违法所得应由司法机关追缴，与你无关，对方无权通过民事诉讼要求你返还。

二、若欠条存在瑕疵或你明知资金来源违法

1. 欠条因违法无效：若欠条是对方以胁迫、欺诈手段迫使你出具，或你明知资金是贪污所得仍接受并出具欠条，根据《民法典》第一百五十三条、第一百五十四条，欠条可能因违反法律强制性规定或违背公序良俗而被认定无效。此时，对方起诉你诈骗，若法院认定欠条无效，可能判决你返还资金，但返还对象应是司法机关（作为违法所得追缴），而非对方个人。
2. 你可能涉嫌共犯或掩饰、隐瞒犯罪所得：若你明知对方贪污仍与其串通，通过欠条形式转移资金，可能构成贪污罪的共犯或掩饰、隐瞒犯罪所得罪。此时，对方起诉你诈骗可能是虚假诉讼，你不仅可能面临刑事责任，还可能因虚假诉讼被追究民事赔偿责任。

三、若对方确实构成诈骗（你被欺骗出具欠条）

1. 诈骗的构成要件：若对方以非法占有为目的，虚构事实（如谎称资金合法）或隐瞒真相（如隐瞒贪污事实），骗取你出具欠条，可能构成诈骗罪。此时，你作为被害人，有权向公安机关报案，要求追究对方刑事责任，并可通过刑事附带民事诉讼要求对方返还资金。
2. 欠条的效力：若诈骗成立，欠条因对方欺诈行为而无效，你无需履行还款义务。对方起诉你诈骗，法院会驳回其诉讼请求，并可能将案件移送公安机关处理。

法律建议

1. 收集证据：若对方起诉你诈骗，立即收集欠条、资金往来凭证、对方贪污的证据（如司法机关立案通知书、判决书等），证明资金来源违法及欠条合法性。
2. 提出反诉或抗辩：在诉讼中，以“欠条合法有效、无诈骗事实”或“对方虚假诉讼”为由进行抗辩，必要时可提出反诉，要求对方赔偿因虚假诉讼造成的损失。
3. 报警处理：若怀疑对方诈骗，立即向公安机关报案，要求追究对方刑事责任，并通过刑事程序追回资金。

总结：对方能否通过起诉诈骗要回款项，取决于欠条合法性、资金性质及是否存在诈骗事实。若欠条合法且无诈骗，对方无权要回；若欠条违法或存在诈骗，你可能面临返还或刑事责任。建议根据具体情况收集证据，及时咨询专业律师，制定应对策略。如有进一步问题，可直接向我咨询。