结论：在三个人一起贷款，其中一人已还清而另外两人未还清的情况下，处理方式主要取决于贷款的性质（共同贷款或连带责任贷款）以及贷款合同中的具体条款。以下是几种可能的情况及相应的处理建议。
一、共同贷款情况
贷款合同约定：
- 若贷款合同中明确约定了三人共同承担还款责任，且未区分各自还款份额，则通常视为共同贷款。在此情况下，已还清贷款的一人原则上不再承担后续还款责任，但需确认合同中是否有关于部分还款后责任变更的条款。
- 若合同中有关于部分还款后责任变更的条款，如“任一借款人还款后，其他借款人还款责任相应减少”等，则已还清贷款的一人可依据合同条款主张免责。
法律后果：
- 若合同未约定部分还款后责任变更，且已还清贷款的一人无法证明其还款行为已免除其后续责任，则银行或贷款机构仍可能要求其承担连带还款责任（尽管这在实际操作中较为少见，且可能因合同条款不明确而引发争议）。
- 为避免潜在纠纷，已还清贷款的一人可要求银行或贷款机构出具书面证明，确认其已履行全部还款义务，并免除其后续责任。
二、连带责任贷款情况
贷款合同约定：
- 若贷款合同中约定了三人承担连带还款责任，即任一借款人均有义务偿还全部贷款，则已还清贷款的一人虽已履行部分还款义务，但仍可能需对剩余贷款承担连带责任（除非合同另有约定或法律另有规定）。
- 在此情况下，已还清贷款的一人可尝试与银行或贷款机构协商，要求其向未还清贷款的两人追偿，或要求修改合同条款以明确各自还款责任。
法律后果：
- 若银行或贷款机构坚持要求已还清贷款的一人承担连带责任，且合同条款或法律规定支持其主张，则已还清贷款的一人可能需通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
- 在诉讼或仲裁过程中，已还清贷款的一人可主张其已履行部分还款义务，并要求法院或仲裁机构根据合同条款或法律规定确定其后续责任。
三、实际操作建议
审查贷款合同：
- 首先，应仔细审查贷款合同中的条款，特别是关于还款责任、部分还款后责任变更以及连带责任等方面的约定。
与银行或贷款机构沟通：
- 在了解合同条款后，可与银行或贷款机构进行沟通，说明已还清贷款的情况，并要求其出具书面证明或修改合同条款以明确后续责任。
寻求法律帮助：
- 若与银行或贷款机构沟通无果，或合同条款存在争议，可寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决争议。
进一步思考：在处理此类问题时，还需考虑贷款的具体类型（如个人消费贷款、经营贷款等）、贷款期限、利率以及还款方式等因素，这些因素可能影响贷款合同的解释和后续责任的处理。因此，在具体操作中，建议根据实际情况咨询专业律师，以制定更为精准和有效的解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。