员工往自己公司的系统上传木马的行为，通常是违法的，可能涉及多个法律责任。以下从不同角度为你详细分析：
一、从刑事责任角度
破坏计算机信息系统罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百八十六条，违反国家规定，对计算机信息系统功能进行删除、修改、增加、干扰，造成计算机信息系统不能正常运行，后果严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处五年以上有期徒刑。
- 如果员工上传的木马程序导致公司计算机信息系统功能受到破坏，且后果严重，那么该员工可能构成破坏计算机信息系统罪。
非法侵入计算机信息系统罪与非法控制计算机信息系统罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百八十五条，违反国家规定，侵入国家事务、国防建设、尖端科学技术领域的计算机信息系统的，处三年以下有期徒刑或者拘役。
- 违反国家规定，侵入前款规定以外的计算机信息系统或者采用其他技术手段，获取该计算机信息系统中存储、处理或者传输的数据，或者对该计算机信息系统实施非法控制，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
- 如果员工上传木马是为了非法侵入或控制公司计算机信息系统，且情节严重，那么该员工可能构成非法侵入计算机信息系统罪或非法控制计算机信息系统罪。
二、从民事责任角度
侵权责任：
- 员工上传木马的行为可能侵犯公司的财产权（如计算机信息系统本身的价值、因系统瘫痪导致的业务损失等）和知识产权（如公司数据、软件等）。
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，侵权人应当承担侵权责任，包括停止侵害、赔偿损失等。
违约责任：
- 如果员工与公司之间存在劳动合同或保密协议等，且这些协议中明确规定了员工不得从事上传木马等危害公司计算机信息系统安全的行为，那么员工上传木马的行为可能构成违约。
- 根据合同法的相关规定，违约方应当承担违约责任，包括继续履行、采取补救措施、赔偿损失等。
三、从劳动纪律角度
- 员工上传木马的行为严重违反了公司的劳动纪律和规章制度，公司有权依据相关规定对员工进行纪律处分，包括警告、罚款、解除劳动合同等。
四、建议与后果
- 建议：作为员工，应当严格遵守公司的规章制度和法律法规，不得从事任何危害公司计算机信息系统安全的行为。如果发现公司计算机信息系统存在安全隐患或漏洞，应当及时向公司报告并协助修复。
- 后果：如果员工上传木马的行为被公司发现或被司法机关查处，将可能面临刑事处罚、民事赔偿和劳动纪律处分等多重后果。这些后果不仅会对员工的个人声誉和职业生涯造成严重影响，还可能对员工的家庭和生活带来不可估量的损失。
综上所述，员工往自己公司的系统上传木马的行为是违法的，可能涉及刑事责任、民事责任和劳动纪律处分等多重后果。因此，我强烈建议员工不要从事此类行为，并时刻保持对法律法规的敬畏之心。如果你有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。