在办理窝案时，是否会一起起诉，这主要取决于案件的具体情况和司法机关的办案策略，但通常情况下，对于共同犯罪的窝案，司法机关倾向于一起起诉。以下是对此问题的详细分析：

1. 共同犯罪与窝案的定义：

   • 共同犯罪是指二人以上共同故意犯罪。在窝案中，通常涉及多个犯罪嫌疑人或被告人，他们之间可能存在共同的犯罪故意和犯罪行为，如共同贪污、共同受贿等。

2. 一起起诉的法律依据与考量：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于共同犯罪案件，司法机关可以一并审理，以便更全面地查明案件事实，准确适用法律，确保审判的公正和效率。
   • 考量因素：司法机关在决定是否一起起诉时，会综合考虑案件的复杂性、犯罪嫌疑人的数量、犯罪行为的关联性、证据的充分性以及审判资源的合理利用等因素。如果案件涉及多个犯罪嫌疑人，且他们的犯罪行为相互关联，证据充分，那么一起起诉通常更为合适。

3. 分开起诉的例外情况：

   • 案件复杂性：如果窝案涉及多个犯罪嫌疑人，但案件事实复杂，证据分散，或者不同犯罪嫌疑人的犯罪行为相对独立，那么司法机关可能会考虑分开起诉，以便更细致地审理每个案件。
   • 审判效率与资源：在某些情况下，如果一起起诉会导致审判过程过于冗长或复杂，或者审判资源有限，司法机关也可能会选择分开起诉，以确保每个案件都能得到及时、公正的审理。

4. 实际操作中的策略：

   • 司法机关的自由裁量权：在办理窝案时，司法机关拥有一定的自由裁量权，可以根据案件的具体情况和审判需要，灵活决定是否一起起诉。
   • 灵活性与公正性：司法机关在决定起诉方式时，会力求在保障审判公正性的同时，提高审判效率，合理利用审判资源。

总结来说，在办理窝案时，司法机关通常会倾向于一起起诉共同犯罪的嫌疑人或被告人，以便更全面地查明案件事实，准确适用法律。然而，如果案件情况复杂或审判资源有限，司法机关也可能会选择分开起诉。如果您有具体的窝案情况或法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。