投资款逾期缴纳滞纳金的计算需根据具体合同约定或法律规定来确定，核心结论如下：

1. 合同有明确约定时
   若投资协议中明确约定了逾期缴纳投资款的滞纳金计算方式（如按日加收万分之五的违约金，或按未缴纳金额的固定比例计算），则优先适用合同约定。
   示例：若合同约定“逾期每日按未缴纳金额的0.05%支付滞纳金”，则滞纳金=未缴纳金额×0.05%×逾期天数。
   注意：合同约定的滞纳金需符合法律强制性规定（如不得超过实际损失的30%），否则可能被法院调整。

2. 合同未约定或约定无效时
   若合同未约定滞纳金，或约定因违反法律（如约定过高）被认定无效，则可能适用以下规则：

   • 参照民间借贷利率上限：根据《民法典》及相关司法解释，逾期付款的违约金可参照一年期贷款市场报价利率（LPR）的4倍计算（目前约15.4%/年）。
     
   • 实际损失赔偿：若能证明逾期导致实际损失（如融资成本增加、项目停滞损失等），可主张赔偿实际损失，但需提供证据支持。

3. 特殊场景下的滞纳金规则

   • 公司增资扩股：若逾期缴纳增资款，可能涉及《公司法》关于股东出资义务的规定，公司可要求违约股东补缴出资并赔偿损失，但“滞纳金”需通过合同约定或股东会决议明确。
     
   • 合伙企业出资：合伙协议可约定逾期出资的违约金，但需全体合伙人一致同意，且不得违反法律强制性规定。

建议：

• 优先审查投资协议中的滞纳金条款，确认其合法性及计算方式；
  
• 若无约定或约定模糊，可结合实际损失、行业惯例等与对方协商，或通过法律途径主张合理赔偿；
  
• 涉及复杂交易结构或大额资金时，建议提前咨询律师设计合规条款，避免纠纷。
  

如有具体合同条款或案件细节，可进一步向我提供，我会为您详细分析。