审查起诉超出法定期限，将严重侵犯犯罪嫌疑人的合法权益，影响司法程序和司法公信力，并可能对案件处理结果的公正性产生负面影响。以下是对这一问题的详细分析：
一、对犯罪嫌疑人权益的影响
人身自由受限延长：
- 审查起诉超期意味着犯罪嫌疑人被非法羁押的时间延长，直接侵犯了其人身自由权。根据法律规定，犯罪嫌疑人有权要求解除超期的羁押措施，变更为取保候审或监视居住等相对限制较小的强制措施。若最终认定无罪或判决刑期低于超期羁押期限，犯罪嫌疑人还有权依据《中华人民共和国国家赔偿法》获得国家赔偿，包括对人身自由受限造成的损失。
精神压力和不确定性增加：
- 长期处于未决状态会给犯罪嫌疑人及其家属带来极大的精神压力和不确定性。他们可能面临社会舆论的压力、家庭关系的紧张以及未来生活的不确定性，这些都会对其心理健康产生负面影响。
辩护权行使受阻：
- 超期审查起诉会妨碍犯罪嫌疑人辩护权的有效行使。辩护律师需要在合理时间内准备辩护策略和收集证据，而超期可能导致案件久拖不决，使辩护工作难以顺利开展，进而影响犯罪嫌疑人及时获得有效的法律帮助和辩护。
二、对司法程序和司法公信力的影响
违反法定程序：
- 审查起诉超期是对法定程序的严重违反，破坏了司法程序的严肃性和规范性。上级检察机关或其他监督机关可以认定该行为违法，并要求承办案件的检察院进行纠正。
案件处理效率降低：
- 超期导致案件积压，延长办理周期，浪费司法资源，并影响其他案件的正常审理进度。这不仅降低了司法效率，还可能导致司法资源的分配不均，影响司法公正。
损害司法公信力：
- 频繁发生的超期审查起诉行为会使公众对司法机关的执法能力和公正性产生质疑，严重损害司法机关的形象和司法公信力。公众可能对司法机关产生不信任感，进而影响司法权威和司法制度的稳定运行。
三、对案件本身处理结果的影响
证据的时效性和证明力受影响：
- 随时间推移，关键证据可能发生变化，如证人记忆模糊、证据灭失等，从而影响证据的时效性和证明力。这增加了误判的风险，可能导致案件事实认定出现偏差。
影响案件最终处理结果的公正性：
- 超期可能导致案件事实认定出现偏差，影响检察官的判断和决策，从而影响案件处理的公正性。若因超期导致证据不足或证据失真，可能使犯罪嫌疑人受到不公正的待遇或处罚。
四、相关人员可能承担的责任
内部监督和纪律处分：
- 司法机关内部有严格的监督机制，对超期审查起诉的情况会进行调查评估，并根据情况对办案人员给予纪律处分。这包括批评教育、绩效扣分、诫勉谈话等措施，以督促办案人员严格遵守法定程序。
法律责任的追究：
- 若办案人员的行为构成滥用职权、玩忽职守等犯罪，还可能被依法追究刑事责任。这体现了法律对司法人员违法行为的严厉打击和制裁。
五、超期后的法律救济途径
- 对于检察院超过起诉期限的情况，相关当事人可以依法提出申诉或控告，要求检察院依法履行职责。同时，也可以向上级检察院或有关监督机关反映情况，寻求法律救济。在超期羁押的情况下，当事人及其家属有权要求立即释放当事人，并可以依据《中华人民共和国国家赔偿法》申请国家赔偿。
综上所述，审查起诉超出法定期限的后果是严重的，它不仅侵犯了犯罪嫌疑人的合法权益，还影响了司法程序的规范性和公正性，以及案件处理结果的准确性。因此，司法机关必须严格遵守法定时限，确保司法公正和效率。若您或您身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我将根据具体情况为您提供专业的法律建议和帮助。